Protein–RNA interactions for Protein: E1U8D0

Soga1, Protein SOGA1, mousemouse

Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga1E1U8D0 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Soga1E1U8D0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Soga1E1U8D0 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Soga1E1U8D0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Soga1E1U8D0 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Soga1E1U8D0 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Soga1E1U8D0 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Soga1E1U8D0 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Soga1E1U8D0 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Soga1E1U8D0 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Soga1E1U8D0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Soga1E1U8D0 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Soga1E1U8D0 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Soga1E1U8D0 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Soga1E1U8D0 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Soga1E1U8D0 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Soga1E1U8D0 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Soga1E1U8D0 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Soga1E1U8D0 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Soga1E1U8D0 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Soga1E1U8D0 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Soga1E1U8D0 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Soga1E1U8D0 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Soga1E1U8D0 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Soga1E1U8D0 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Soga1E1U8D0 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Soga1E1U8D0 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Soga1E1U8D0 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Soga1E1U8D0 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Soga1E1U8D0 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Soga1E1U8D0 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Soga1E1U8D0 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Soga1E1U8D0 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Soga1E1U8D0 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Soga1E1U8D0 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Soga1E1U8D0 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Soga1E1U8D0 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Soga1E1U8D0 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Soga1E1U8D0 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Soga1E1U8D0 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Soga1E1U8D0 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Soga1E1U8D0 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Soga1E1U8D0 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Soga1E1U8D0 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Soga1E1U8D0 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Soga1E1U8D0 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Soga1E1U8D0 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Soga1E1U8D0 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Soga1E1U8D0 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Soga1E1U8D0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Soga1E1U8D0 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Soga1E1U8D0 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Soga1E1U8D0 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Soga1E1U8D0 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Soga1E1U8D0 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Soga1E1U8D0 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Soga1E1U8D0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Soga1E1U8D0 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Soga1E1U8D0 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Soga1E1U8D0 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Soga1E1U8D0 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Soga1E1U8D0 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Soga1E1U8D0 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Soga1E1U8D0 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Soga1E1U8D0 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Soga1E1U8D0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Soga1E1U8D0 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Soga1E1U8D0 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Soga1E1U8D0 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Soga1E1U8D0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Soga1E1U8D0 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Soga1E1U8D0 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Soga1E1U8D0 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Soga1E1U8D0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Soga1E1U8D0 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Soga1E1U8D0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Soga1E1U8D0 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Soga1E1U8D0 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Soga1E1U8D0 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Soga1E1U8D0 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Soga1E1U8D0 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Soga1E1U8D0 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Soga1E1U8D0 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Soga1E1U8D0 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Soga1E1U8D0 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Soga1E1U8D0 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Soga1E1U8D0 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Soga1E1U8D0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Soga1E1U8D0 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Soga1E1U8D0 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Soga1E1U8D0 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Soga1E1U8D0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Soga1E1U8D0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Soga1E1U8D0 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Soga1E1U8D0 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Soga1E1U8D0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Soga1E1U8D0 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Soga1E1U8D0 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Soga1E1U8D0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Soga1E1U8D0 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms