Protein–RNA interactions for Protein: E0CXM8

Gm43720, Predicted gene 43720, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm43720E0CXM8 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm43720E0CXM8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm43720E0CXM8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm43720E0CXM8 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm43720E0CXM8 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm43720E0CXM8 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm43720E0CXM8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm43720E0CXM8 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm43720E0CXM8 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm43720E0CXM8 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm43720E0CXM8 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm43720E0CXM8 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm43720E0CXM8 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm43720E0CXM8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm43720E0CXM8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm43720E0CXM8 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm43720E0CXM8 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm43720E0CXM8 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm43720E0CXM8 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm43720E0CXM8 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm43720E0CXM8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm43720E0CXM8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm43720E0CXM8 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm43720E0CXM8 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm43720E0CXM8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm43720E0CXM8 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm43720E0CXM8 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm43720E0CXM8 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm43720E0CXM8 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm43720E0CXM8 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm43720E0CXM8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm43720E0CXM8 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm43720E0CXM8 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm43720E0CXM8 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm43720E0CXM8 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm43720E0CXM8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm43720E0CXM8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm43720E0CXM8 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm43720E0CXM8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm43720E0CXM8 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm43720E0CXM8 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm43720E0CXM8 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm43720E0CXM8 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm43720E0CXM8 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm43720E0CXM8 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm43720E0CXM8 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm43720E0CXM8 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm43720E0CXM8 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm43720E0CXM8 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm43720E0CXM8 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm43720E0CXM8 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm43720E0CXM8 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm43720E0CXM8 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm43720E0CXM8 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm43720E0CXM8 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm43720E0CXM8 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm43720E0CXM8 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm43720E0CXM8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm43720E0CXM8 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm43720E0CXM8 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm43720E0CXM8 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm43720E0CXM8 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm43720E0CXM8 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm43720E0CXM8 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm43720E0CXM8 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm43720E0CXM8 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm43720E0CXM8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm43720E0CXM8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm43720E0CXM8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm43720E0CXM8 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm43720E0CXM8 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm43720E0CXM8 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm43720E0CXM8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm43720E0CXM8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm43720E0CXM8 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm43720E0CXM8 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm43720E0CXM8 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm43720E0CXM8 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm43720E0CXM8 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm43720E0CXM8 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm43720E0CXM8 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm43720E0CXM8 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm43720E0CXM8 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm43720E0CXM8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm43720E0CXM8 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm43720E0CXM8 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm43720E0CXM8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm43720E0CXM8 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm43720E0CXM8 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm43720E0CXM8 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm43720E0CXM8 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm43720E0CXM8 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm43720E0CXM8 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm43720E0CXM8 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm43720E0CXM8 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm43720E0CXM8 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm43720E0CXM8 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm43720E0CXM8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm43720E0CXM8 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm43720E0CXM8 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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