Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6W3

Rdh8, Retinol dehydrogenase 8, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh8D3Z6W3 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rdh8D3Z6W3 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rdh8D3Z6W3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rdh8D3Z6W3 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rdh8D3Z6W3 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rdh8D3Z6W3 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rdh8D3Z6W3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rdh8D3Z6W3 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rdh8D3Z6W3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rdh8D3Z6W3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rdh8D3Z6W3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rdh8D3Z6W3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rdh8D3Z6W3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rdh8D3Z6W3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rdh8D3Z6W3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rdh8D3Z6W3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rdh8D3Z6W3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rdh8D3Z6W3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rdh8D3Z6W3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rdh8D3Z6W3 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rdh8D3Z6W3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rdh8D3Z6W3 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rdh8D3Z6W3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rdh8D3Z6W3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rdh8D3Z6W3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rdh8D3Z6W3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rdh8D3Z6W3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rdh8D3Z6W3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rdh8D3Z6W3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rdh8D3Z6W3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rdh8D3Z6W3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rdh8D3Z6W3 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rdh8D3Z6W3 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rdh8D3Z6W3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rdh8D3Z6W3 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rdh8D3Z6W3 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rdh8D3Z6W3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rdh8D3Z6W3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rdh8D3Z6W3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rdh8D3Z6W3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rdh8D3Z6W3 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rdh8D3Z6W3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rdh8D3Z6W3 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rdh8D3Z6W3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rdh8D3Z6W3 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rdh8D3Z6W3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rdh8D3Z6W3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rdh8D3Z6W3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rdh8D3Z6W3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rdh8D3Z6W3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rdh8D3Z6W3 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rdh8D3Z6W3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rdh8D3Z6W3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rdh8D3Z6W3 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rdh8D3Z6W3 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rdh8D3Z6W3 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rdh8D3Z6W3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rdh8D3Z6W3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rdh8D3Z6W3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rdh8D3Z6W3 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rdh8D3Z6W3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rdh8D3Z6W3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rdh8D3Z6W3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rdh8D3Z6W3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rdh8D3Z6W3 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rdh8D3Z6W3 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rdh8D3Z6W3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rdh8D3Z6W3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rdh8D3Z6W3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rdh8D3Z6W3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rdh8D3Z6W3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rdh8D3Z6W3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rdh8D3Z6W3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rdh8D3Z6W3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rdh8D3Z6W3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rdh8D3Z6W3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rdh8D3Z6W3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rdh8D3Z6W3 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rdh8D3Z6W3 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rdh8D3Z6W3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rdh8D3Z6W3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rdh8D3Z6W3 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rdh8D3Z6W3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rdh8D3Z6W3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rdh8D3Z6W3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rdh8D3Z6W3 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rdh8D3Z6W3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rdh8D3Z6W3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rdh8D3Z6W3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rdh8D3Z6W3 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rdh8D3Z6W3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rdh8D3Z6W3 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rdh8D3Z6W3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rdh8D3Z6W3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rdh8D3Z6W3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rdh8D3Z6W3 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rdh8D3Z6W3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rdh8D3Z6W3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rdh8D3Z6W3 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rdh8D3Z6W3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms