Protein–RNA interactions for Protein: D3Z4U6

Gm5934, Predicted gene 5934, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5934D3Z4U6 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm5934D3Z4U6 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm5934D3Z4U6 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm5934D3Z4U6 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm5934D3Z4U6 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm5934D3Z4U6 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm5934D3Z4U6 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm5934D3Z4U6 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Gm5934D3Z4U6 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm5934D3Z4U6 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm5934D3Z4U6 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm5934D3Z4U6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm5934D3Z4U6 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm5934D3Z4U6 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm5934D3Z4U6 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm5934D3Z4U6 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm5934D3Z4U6 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm5934D3Z4U6 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm5934D3Z4U6 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm5934D3Z4U6 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm5934D3Z4U6 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm5934D3Z4U6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm5934D3Z4U6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm5934D3Z4U6 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm5934D3Z4U6 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm5934D3Z4U6 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm5934D3Z4U6 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm5934D3Z4U6 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm5934D3Z4U6 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm5934D3Z4U6 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm5934D3Z4U6 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm5934D3Z4U6 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm5934D3Z4U6 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm5934D3Z4U6 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm5934D3Z4U6 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm5934D3Z4U6 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm5934D3Z4U6 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm5934D3Z4U6 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm5934D3Z4U6 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm5934D3Z4U6 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm5934D3Z4U6 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm5934D3Z4U6 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm5934D3Z4U6 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm5934D3Z4U6 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm5934D3Z4U6 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm5934D3Z4U6 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm5934D3Z4U6 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm5934D3Z4U6 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm5934D3Z4U6 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm5934D3Z4U6 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm5934D3Z4U6 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm5934D3Z4U6 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm5934D3Z4U6 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm5934D3Z4U6 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm5934D3Z4U6 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm5934D3Z4U6 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm5934D3Z4U6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm5934D3Z4U6 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm5934D3Z4U6 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm5934D3Z4U6 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm5934D3Z4U6 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm5934D3Z4U6 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm5934D3Z4U6 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm5934D3Z4U6 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm5934D3Z4U6 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm5934D3Z4U6 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm5934D3Z4U6 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm5934D3Z4U6 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm5934D3Z4U6 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm5934D3Z4U6 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm5934D3Z4U6 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gm5934D3Z4U6 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gm5934D3Z4U6 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gm5934D3Z4U6 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm5934D3Z4U6 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm5934D3Z4U6 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm5934D3Z4U6 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm5934D3Z4U6 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm5934D3Z4U6 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm5934D3Z4U6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm5934D3Z4U6 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm5934D3Z4U6 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm5934D3Z4U6 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm5934D3Z4U6 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm5934D3Z4U6 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm5934D3Z4U6 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm5934D3Z4U6 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm5934D3Z4U6 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm5934D3Z4U6 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm5934D3Z4U6 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm5934D3Z4U6 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm5934D3Z4U6 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm5934D3Z4U6 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm5934D3Z4U6 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm5934D3Z4U6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm5934D3Z4U6 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm5934D3Z4U6 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm5934D3Z4U6 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm5934D3Z4U6 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm5934D3Z4U6 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms