Protein–RNA interactions for Protein: D3Z1D3

3425401B19Rik, RIKEN cDNA 3425401B19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3425401B19RikD3Z1D3 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
3425401B19RikD3Z1D3 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
3425401B19RikD3Z1D3 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
3425401B19RikD3Z1D3 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
3425401B19RikD3Z1D3 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
3425401B19RikD3Z1D3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
3425401B19RikD3Z1D3 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
3425401B19RikD3Z1D3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
3425401B19RikD3Z1D3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
3425401B19RikD3Z1D3 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
3425401B19RikD3Z1D3 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
3425401B19RikD3Z1D3 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
3425401B19RikD3Z1D3 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
3425401B19RikD3Z1D3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
3425401B19RikD3Z1D3 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
3425401B19RikD3Z1D3 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
3425401B19RikD3Z1D3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
3425401B19RikD3Z1D3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
3425401B19RikD3Z1D3 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
3425401B19RikD3Z1D3 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
3425401B19RikD3Z1D3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
3425401B19RikD3Z1D3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
3425401B19RikD3Z1D3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
3425401B19RikD3Z1D3 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
3425401B19RikD3Z1D3 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
3425401B19RikD3Z1D3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
3425401B19RikD3Z1D3 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
3425401B19RikD3Z1D3 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
3425401B19RikD3Z1D3 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
3425401B19RikD3Z1D3 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
3425401B19RikD3Z1D3 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
3425401B19RikD3Z1D3 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
3425401B19RikD3Z1D3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
3425401B19RikD3Z1D3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
3425401B19RikD3Z1D3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
3425401B19RikD3Z1D3 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
3425401B19RikD3Z1D3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
3425401B19RikD3Z1D3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
3425401B19RikD3Z1D3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
3425401B19RikD3Z1D3 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
3425401B19RikD3Z1D3 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
3425401B19RikD3Z1D3 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
3425401B19RikD3Z1D3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
3425401B19RikD3Z1D3 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
3425401B19RikD3Z1D3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
3425401B19RikD3Z1D3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
3425401B19RikD3Z1D3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
3425401B19RikD3Z1D3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
3425401B19RikD3Z1D3 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
3425401B19RikD3Z1D3 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
3425401B19RikD3Z1D3 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
3425401B19RikD3Z1D3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
3425401B19RikD3Z1D3 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
3425401B19RikD3Z1D3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
3425401B19RikD3Z1D3 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
3425401B19RikD3Z1D3 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
3425401B19RikD3Z1D3 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
3425401B19RikD3Z1D3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
3425401B19RikD3Z1D3 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
3425401B19RikD3Z1D3 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
3425401B19RikD3Z1D3 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
3425401B19RikD3Z1D3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
3425401B19RikD3Z1D3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
3425401B19RikD3Z1D3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
3425401B19RikD3Z1D3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
3425401B19RikD3Z1D3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
3425401B19RikD3Z1D3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
3425401B19RikD3Z1D3 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
3425401B19RikD3Z1D3 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
3425401B19RikD3Z1D3 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
3425401B19RikD3Z1D3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
3425401B19RikD3Z1D3 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
3425401B19RikD3Z1D3 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
3425401B19RikD3Z1D3 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
3425401B19RikD3Z1D3 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
3425401B19RikD3Z1D3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
3425401B19RikD3Z1D3 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
3425401B19RikD3Z1D3 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
3425401B19RikD3Z1D3 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
3425401B19RikD3Z1D3 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
3425401B19RikD3Z1D3 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
3425401B19RikD3Z1D3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
3425401B19RikD3Z1D3 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
3425401B19RikD3Z1D3 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
3425401B19RikD3Z1D3 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
3425401B19RikD3Z1D3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
3425401B19RikD3Z1D3 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
3425401B19RikD3Z1D3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
3425401B19RikD3Z1D3 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
3425401B19RikD3Z1D3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
3425401B19RikD3Z1D3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
3425401B19RikD3Z1D3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
3425401B19RikD3Z1D3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
3425401B19RikD3Z1D3 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
3425401B19RikD3Z1D3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
3425401B19RikD3Z1D3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
3425401B19RikD3Z1D3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
3425401B19RikD3Z1D3 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
3425401B19RikD3Z1D3 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
3425401B19RikD3Z1D3 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms