Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc6D3YZP9 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc6D3YZP9 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc6D3YZP9 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc6D3YZP9 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc6D3YZP9 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc6D3YZP9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc6D3YZP9 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc6D3YZP9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc6D3YZP9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc6D3YZP9 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc6D3YZP9 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc6D3YZP9 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc6D3YZP9 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc6D3YZP9 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc6D3YZP9 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc6D3YZP9 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc6D3YZP9 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc6D3YZP9 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc6D3YZP9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc6D3YZP9 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc6D3YZP9 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Ccdc6D3YZP9 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Ccdc6D3YZP9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc6D3YZP9 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc6D3YZP9 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc6D3YZP9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc6D3YZP9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc6D3YZP9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc6D3YZP9 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc6D3YZP9 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc6D3YZP9 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc6D3YZP9 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc6D3YZP9 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc6D3YZP9 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc6D3YZP9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc6D3YZP9 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc6D3YZP9 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc6D3YZP9 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc6D3YZP9 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc6D3YZP9 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc6D3YZP9 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc6D3YZP9 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc6D3YZP9 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc6D3YZP9 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc6D3YZP9 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc6D3YZP9 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc6D3YZP9 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc6D3YZP9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc6D3YZP9 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc6D3YZP9 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc6D3YZP9 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc6D3YZP9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc6D3YZP9 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc6D3YZP9 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc6D3YZP9 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc6D3YZP9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc6D3YZP9 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc6D3YZP9 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc6D3YZP9 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc6D3YZP9 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc6D3YZP9 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc6D3YZP9 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc6D3YZP9 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc6D3YZP9 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc6D3YZP9 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc6D3YZP9 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc6D3YZP9 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc6D3YZP9 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc6D3YZP9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc6D3YZP9 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc6D3YZP9 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc6D3YZP9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc6D3YZP9 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc6D3YZP9 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc6D3YZP9 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc6D3YZP9 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc6D3YZP9 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc6D3YZP9 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc6D3YZP9 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc6D3YZP9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc6D3YZP9 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc6D3YZP9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc6D3YZP9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc6D3YZP9 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc6D3YZP9 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc6D3YZP9 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc6D3YZP9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc6D3YZP9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc6D3YZP9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc6D3YZP9 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc6D3YZP9 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc6D3YZP9 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc6D3YZP9 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc6D3YZP9 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc6D3YZP9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc6D3YZP9 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc6D3YZP9 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc6D3YZP9 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc6D3YZP9 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms