Protein–RNA interactions for Protein: D3YXE9

BC048679, cDNA sequence BC048679, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC048679D3YXE9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BC048679D3YXE9 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BC048679D3YXE9 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BC048679D3YXE9 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BC048679D3YXE9 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BC048679D3YXE9 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BC048679D3YXE9 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BC048679D3YXE9 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BC048679D3YXE9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BC048679D3YXE9 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BC048679D3YXE9 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BC048679D3YXE9 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
BC048679D3YXE9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BC048679D3YXE9 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BC048679D3YXE9 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BC048679D3YXE9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BC048679D3YXE9 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BC048679D3YXE9 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BC048679D3YXE9 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BC048679D3YXE9 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BC048679D3YXE9 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BC048679D3YXE9 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BC048679D3YXE9 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BC048679D3YXE9 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BC048679D3YXE9 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BC048679D3YXE9 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BC048679D3YXE9 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BC048679D3YXE9 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BC048679D3YXE9 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BC048679D3YXE9 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BC048679D3YXE9 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BC048679D3YXE9 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BC048679D3YXE9 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BC048679D3YXE9 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BC048679D3YXE9 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BC048679D3YXE9 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BC048679D3YXE9 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BC048679D3YXE9 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BC048679D3YXE9 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BC048679D3YXE9 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BC048679D3YXE9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BC048679D3YXE9 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BC048679D3YXE9 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BC048679D3YXE9 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BC048679D3YXE9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BC048679D3YXE9 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BC048679D3YXE9 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BC048679D3YXE9 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BC048679D3YXE9 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BC048679D3YXE9 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BC048679D3YXE9 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BC048679D3YXE9 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BC048679D3YXE9 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BC048679D3YXE9 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BC048679D3YXE9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BC048679D3YXE9 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BC048679D3YXE9 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BC048679D3YXE9 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BC048679D3YXE9 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BC048679D3YXE9 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BC048679D3YXE9 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BC048679D3YXE9 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BC048679D3YXE9 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BC048679D3YXE9 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BC048679D3YXE9 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BC048679D3YXE9 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BC048679D3YXE9 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BC048679D3YXE9 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BC048679D3YXE9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BC048679D3YXE9 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BC048679D3YXE9 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BC048679D3YXE9 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BC048679D3YXE9 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BC048679D3YXE9 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BC048679D3YXE9 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BC048679D3YXE9 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BC048679D3YXE9 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BC048679D3YXE9 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BC048679D3YXE9 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BC048679D3YXE9 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BC048679D3YXE9 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BC048679D3YXE9 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BC048679D3YXE9 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BC048679D3YXE9 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BC048679D3YXE9 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC048679D3YXE9 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC048679D3YXE9 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC048679D3YXE9 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC048679D3YXE9 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC048679D3YXE9 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC048679D3YXE9 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC048679D3YXE9 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC048679D3YXE9 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC048679D3YXE9 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC048679D3YXE9 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC048679D3YXE9 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BC048679D3YXE9 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC048679D3YXE9 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC048679D3YXE9 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BC048679D3YXE9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms