Protein–RNA interactions for Protein: D3YWC7

Fam47e, Family with sequence similarity 47, member E, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam47eD3YWC7 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam47eD3YWC7 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam47eD3YWC7 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam47eD3YWC7 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam47eD3YWC7 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam47eD3YWC7 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam47eD3YWC7 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam47eD3YWC7 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam47eD3YWC7 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam47eD3YWC7 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam47eD3YWC7 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam47eD3YWC7 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam47eD3YWC7 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam47eD3YWC7 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam47eD3YWC7 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam47eD3YWC7 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam47eD3YWC7 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam47eD3YWC7 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam47eD3YWC7 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam47eD3YWC7 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam47eD3YWC7 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam47eD3YWC7 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam47eD3YWC7 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam47eD3YWC7 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam47eD3YWC7 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam47eD3YWC7 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam47eD3YWC7 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam47eD3YWC7 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam47eD3YWC7 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam47eD3YWC7 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam47eD3YWC7 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam47eD3YWC7 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam47eD3YWC7 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam47eD3YWC7 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam47eD3YWC7 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam47eD3YWC7 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam47eD3YWC7 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam47eD3YWC7 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam47eD3YWC7 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam47eD3YWC7 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam47eD3YWC7 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam47eD3YWC7 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam47eD3YWC7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam47eD3YWC7 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam47eD3YWC7 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam47eD3YWC7 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam47eD3YWC7 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam47eD3YWC7 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam47eD3YWC7 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam47eD3YWC7 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam47eD3YWC7 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam47eD3YWC7 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam47eD3YWC7 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam47eD3YWC7 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam47eD3YWC7 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam47eD3YWC7 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam47eD3YWC7 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam47eD3YWC7 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam47eD3YWC7 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam47eD3YWC7 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam47eD3YWC7 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam47eD3YWC7 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam47eD3YWC7 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam47eD3YWC7 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fam47eD3YWC7 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam47eD3YWC7 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam47eD3YWC7 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam47eD3YWC7 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam47eD3YWC7 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam47eD3YWC7 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam47eD3YWC7 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam47eD3YWC7 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam47eD3YWC7 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam47eD3YWC7 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam47eD3YWC7 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam47eD3YWC7 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam47eD3YWC7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam47eD3YWC7 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam47eD3YWC7 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam47eD3YWC7 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam47eD3YWC7 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam47eD3YWC7 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam47eD3YWC7 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam47eD3YWC7 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Fam47eD3YWC7 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam47eD3YWC7 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam47eD3YWC7 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam47eD3YWC7 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam47eD3YWC7 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Fam47eD3YWC7 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam47eD3YWC7 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam47eD3YWC7 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam47eD3YWC7 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Fam47eD3YWC7 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam47eD3YWC7 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam47eD3YWC7 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam47eD3YWC7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam47eD3YWC7 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam47eD3YWC7 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam47eD3YWC7 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms