Protein–RNA interactions for Protein: B9EKE5

Catip, Ciliogenesis-associated TTC17-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatipB9EKE5 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CatipB9EKE5 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CatipB9EKE5 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CatipB9EKE5 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CatipB9EKE5 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CatipB9EKE5 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CatipB9EKE5 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CatipB9EKE5 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CatipB9EKE5 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CatipB9EKE5 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CatipB9EKE5 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CatipB9EKE5 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CatipB9EKE5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CatipB9EKE5 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CatipB9EKE5 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CatipB9EKE5 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CatipB9EKE5 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CatipB9EKE5 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CatipB9EKE5 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CatipB9EKE5 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CatipB9EKE5 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CatipB9EKE5 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CatipB9EKE5 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CatipB9EKE5 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CatipB9EKE5 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CatipB9EKE5 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CatipB9EKE5 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CatipB9EKE5 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CatipB9EKE5 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CatipB9EKE5 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CatipB9EKE5 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CatipB9EKE5 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CatipB9EKE5 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CatipB9EKE5 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CatipB9EKE5 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CatipB9EKE5 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CatipB9EKE5 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CatipB9EKE5 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CatipB9EKE5 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CatipB9EKE5 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CatipB9EKE5 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CatipB9EKE5 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CatipB9EKE5 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CatipB9EKE5 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CatipB9EKE5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CatipB9EKE5 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CatipB9EKE5 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CatipB9EKE5 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CatipB9EKE5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CatipB9EKE5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CatipB9EKE5 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CatipB9EKE5 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CatipB9EKE5 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CatipB9EKE5 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CatipB9EKE5 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CatipB9EKE5 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CatipB9EKE5 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CatipB9EKE5 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CatipB9EKE5 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CatipB9EKE5 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CatipB9EKE5 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CatipB9EKE5 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CatipB9EKE5 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CatipB9EKE5 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CatipB9EKE5 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CatipB9EKE5 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CatipB9EKE5 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CatipB9EKE5 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CatipB9EKE5 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CatipB9EKE5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CatipB9EKE5 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CatipB9EKE5 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CatipB9EKE5 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CatipB9EKE5 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CatipB9EKE5 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CatipB9EKE5 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CatipB9EKE5 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CatipB9EKE5 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CatipB9EKE5 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CatipB9EKE5 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CatipB9EKE5 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CatipB9EKE5 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CatipB9EKE5 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CatipB9EKE5 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CatipB9EKE5 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CatipB9EKE5 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CatipB9EKE5 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CatipB9EKE5 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CatipB9EKE5 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CatipB9EKE5 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CatipB9EKE5 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CatipB9EKE5 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CatipB9EKE5 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CatipB9EKE5 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CatipB9EKE5 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CatipB9EKE5 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CatipB9EKE5 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CatipB9EKE5 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CatipB9EKE5 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CatipB9EKE5 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms