Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Phf11bB4XVQ1 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Phf11bB4XVQ1 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Phf11bB4XVQ1 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Phf11bB4XVQ1 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Phf11bB4XVQ1 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Phf11bB4XVQ1 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Phf11bB4XVQ1 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Phf11bB4XVQ1 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Phf11bB4XVQ1 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Phf11bB4XVQ1 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Phf11bB4XVQ1 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Phf11bB4XVQ1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Phf11bB4XVQ1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Phf11bB4XVQ1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Phf11bB4XVQ1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Phf11bB4XVQ1 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Phf11bB4XVQ1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Phf11bB4XVQ1 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Phf11bB4XVQ1 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Phf11bB4XVQ1 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Phf11bB4XVQ1 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Phf11bB4XVQ1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Phf11bB4XVQ1 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Phf11bB4XVQ1 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Phf11bB4XVQ1 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Phf11bB4XVQ1 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Phf11bB4XVQ1 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Phf11bB4XVQ1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Phf11bB4XVQ1 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Phf11bB4XVQ1 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Phf11bB4XVQ1 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Phf11bB4XVQ1 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Phf11bB4XVQ1 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Phf11bB4XVQ1 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Phf11bB4XVQ1 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Phf11bB4XVQ1 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Phf11bB4XVQ1 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Phf11bB4XVQ1 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Phf11bB4XVQ1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Phf11bB4XVQ1 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Phf11bB4XVQ1 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Phf11bB4XVQ1 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Phf11bB4XVQ1 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Phf11bB4XVQ1 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Phf11bB4XVQ1 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Phf11bB4XVQ1 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Phf11bB4XVQ1 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Phf11bB4XVQ1 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Phf11bB4XVQ1 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Phf11bB4XVQ1 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Phf11bB4XVQ1 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Phf11bB4XVQ1 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Phf11bB4XVQ1 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Phf11bB4XVQ1 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Phf11bB4XVQ1 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Phf11bB4XVQ1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Phf11bB4XVQ1 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Phf11bB4XVQ1 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Phf11bB4XVQ1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Phf11bB4XVQ1 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Phf11bB4XVQ1 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Phf11bB4XVQ1 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Phf11bB4XVQ1 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Phf11bB4XVQ1 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Phf11bB4XVQ1 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Phf11bB4XVQ1 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Phf11bB4XVQ1 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Phf11bB4XVQ1 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Phf11bB4XVQ1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Phf11bB4XVQ1 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Phf11bB4XVQ1 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Phf11bB4XVQ1 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Phf11bB4XVQ1 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Phf11bB4XVQ1 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Phf11bB4XVQ1 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Phf11bB4XVQ1 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Phf11bB4XVQ1 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Phf11bB4XVQ1 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Phf11bB4XVQ1 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Phf11bB4XVQ1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Phf11bB4XVQ1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Phf11bB4XVQ1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Phf11bB4XVQ1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Phf11bB4XVQ1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Phf11bB4XVQ1 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Phf11bB4XVQ1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Phf11bB4XVQ1 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Phf11bB4XVQ1 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Phf11bB4XVQ1 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Phf11bB4XVQ1 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Phf11bB4XVQ1 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Phf11bB4XVQ1 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Phf11bB4XVQ1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Phf11bB4XVQ1 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Phf11bB4XVQ1 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Phf11bB4XVQ1 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Phf11bB4XVQ1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Phf11bB4XVQ1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Phf11bB4XVQ1 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms