Protein–RNA interactions for Protein: B2RWG3

Siah3, E3 ubiquitin-protein ligase, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah3B2RWG3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Siah3B2RWG3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Siah3B2RWG3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Siah3B2RWG3 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Siah3B2RWG3 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Siah3B2RWG3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Siah3B2RWG3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Siah3B2RWG3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Siah3B2RWG3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Siah3B2RWG3 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Siah3B2RWG3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Siah3B2RWG3 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Siah3B2RWG3 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Siah3B2RWG3 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Siah3B2RWG3 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Siah3B2RWG3 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Siah3B2RWG3 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Siah3B2RWG3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Siah3B2RWG3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Siah3B2RWG3 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Siah3B2RWG3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Siah3B2RWG3 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Siah3B2RWG3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Siah3B2RWG3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Siah3B2RWG3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Siah3B2RWG3 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Siah3B2RWG3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Siah3B2RWG3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Siah3B2RWG3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Siah3B2RWG3 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Siah3B2RWG3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Siah3B2RWG3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Siah3B2RWG3 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Siah3B2RWG3 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Siah3B2RWG3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Siah3B2RWG3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Siah3B2RWG3 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Siah3B2RWG3 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Siah3B2RWG3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Siah3B2RWG3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Siah3B2RWG3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Siah3B2RWG3 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Siah3B2RWG3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Siah3B2RWG3 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Siah3B2RWG3 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Siah3B2RWG3 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Siah3B2RWG3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Siah3B2RWG3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Siah3B2RWG3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Siah3B2RWG3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Siah3B2RWG3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Siah3B2RWG3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Siah3B2RWG3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Siah3B2RWG3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Siah3B2RWG3 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Siah3B2RWG3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Siah3B2RWG3 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Siah3B2RWG3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Siah3B2RWG3 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Siah3B2RWG3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Siah3B2RWG3 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Siah3B2RWG3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Siah3B2RWG3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Siah3B2RWG3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Siah3B2RWG3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Siah3B2RWG3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Siah3B2RWG3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Siah3B2RWG3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Siah3B2RWG3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Siah3B2RWG3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Siah3B2RWG3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Siah3B2RWG3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Siah3B2RWG3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Siah3B2RWG3 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Siah3B2RWG3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Siah3B2RWG3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Siah3B2RWG3 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Siah3B2RWG3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Siah3B2RWG3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Siah3B2RWG3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Siah3B2RWG3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Siah3B2RWG3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Siah3B2RWG3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Siah3B2RWG3 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Siah3B2RWG3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Siah3B2RWG3 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Siah3B2RWG3 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Siah3B2RWG3 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Siah3B2RWG3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Siah3B2RWG3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Siah3B2RWG3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Siah3B2RWG3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Siah3B2RWG3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Siah3B2RWG3 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Siah3B2RWG3 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Siah3B2RWG3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Siah3B2RWG3 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Siah3B2RWG3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Siah3B2RWG3 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Siah3B2RWG3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms