Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rd3lB2RV38 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rd3lB2RV38 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rd3lB2RV38 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rd3lB2RV38 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rd3lB2RV38 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rd3lB2RV38 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rd3lB2RV38 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rd3lB2RV38 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rd3lB2RV38 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rd3lB2RV38 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rd3lB2RV38 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rd3lB2RV38 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rd3lB2RV38 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rd3lB2RV38 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rd3lB2RV38 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rd3lB2RV38 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rd3lB2RV38 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rd3lB2RV38 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rd3lB2RV38 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rd3lB2RV38 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rd3lB2RV38 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rd3lB2RV38 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rd3lB2RV38 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rd3lB2RV38 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rd3lB2RV38 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rd3lB2RV38 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rd3lB2RV38 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rd3lB2RV38 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rd3lB2RV38 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rd3lB2RV38 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rd3lB2RV38 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rd3lB2RV38 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rd3lB2RV38 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rd3lB2RV38 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rd3lB2RV38 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rd3lB2RV38 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rd3lB2RV38 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rd3lB2RV38 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rd3lB2RV38 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rd3lB2RV38 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rd3lB2RV38 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rd3lB2RV38 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rd3lB2RV38 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rd3lB2RV38 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rd3lB2RV38 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rd3lB2RV38 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rd3lB2RV38 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rd3lB2RV38 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rd3lB2RV38 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rd3lB2RV38 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rd3lB2RV38 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rd3lB2RV38 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rd3lB2RV38 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rd3lB2RV38 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rd3lB2RV38 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rd3lB2RV38 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rd3lB2RV38 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rd3lB2RV38 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rd3lB2RV38 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rd3lB2RV38 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rd3lB2RV38 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rd3lB2RV38 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rd3lB2RV38 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Rd3lB2RV38 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rd3lB2RV38 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rd3lB2RV38 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rd3lB2RV38 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rd3lB2RV38 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rd3lB2RV38 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rd3lB2RV38 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rd3lB2RV38 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rd3lB2RV38 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rd3lB2RV38 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rd3lB2RV38 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rd3lB2RV38 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rd3lB2RV38 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rd3lB2RV38 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rd3lB2RV38 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rd3lB2RV38 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rd3lB2RV38 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rd3lB2RV38 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rd3lB2RV38 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rd3lB2RV38 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rd3lB2RV38 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rd3lB2RV38 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rd3lB2RV38 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rd3lB2RV38 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rd3lB2RV38 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rd3lB2RV38 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rd3lB2RV38 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rd3lB2RV38 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rd3lB2RV38 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rd3lB2RV38 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rd3lB2RV38 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rd3lB2RV38 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rd3lB2RV38 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rd3lB2RV38 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rd3lB2RV38 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rd3lB2RV38 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms