Protein–RNA interactions for Protein: B2RT89

Slc22a28, Predicted gene, EG434674, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc22a28B2RT89 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Slc22a28B2RT89 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Slc22a28B2RT89 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Slc22a28B2RT89 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Slc22a28B2RT89 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Slc22a28B2RT89 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Slc22a28B2RT89 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Slc22a28B2RT89 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Slc22a28B2RT89 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Slc22a28B2RT89 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Slc22a28B2RT89 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Slc22a28B2RT89 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Slc22a28B2RT89 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Slc22a28B2RT89 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Slc22a28B2RT89 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Slc22a28B2RT89 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Slc22a28B2RT89 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Slc22a28B2RT89 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Slc22a28B2RT89 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Slc22a28B2RT89 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Slc22a28B2RT89 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Slc22a28B2RT89 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Slc22a28B2RT89 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Slc22a28B2RT89 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Slc22a28B2RT89 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Slc22a28B2RT89 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Slc22a28B2RT89 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Slc22a28B2RT89 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Slc22a28B2RT89 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Slc22a28B2RT89 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Slc22a28B2RT89 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Slc22a28B2RT89 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Slc22a28B2RT89 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Slc22a28B2RT89 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Slc22a28B2RT89 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Slc22a28B2RT89 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Slc22a28B2RT89 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Slc22a28B2RT89 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Slc22a28B2RT89 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Slc22a28B2RT89 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Slc22a28B2RT89 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Slc22a28B2RT89 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Slc22a28B2RT89 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Slc22a28B2RT89 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Slc22a28B2RT89 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Slc22a28B2RT89 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Slc22a28B2RT89 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Slc22a28B2RT89 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Slc22a28B2RT89 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Slc22a28B2RT89 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Slc22a28B2RT89 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Slc22a28B2RT89 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Slc22a28B2RT89 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Slc22a28B2RT89 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Slc22a28B2RT89 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Slc22a28B2RT89 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
Slc22a28B2RT89 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Slc22a28B2RT89 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Slc22a28B2RT89 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Slc22a28B2RT89 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Slc22a28B2RT89 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Slc22a28B2RT89 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Slc22a28B2RT89 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Slc22a28B2RT89 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Slc22a28B2RT89 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Slc22a28B2RT89 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc22a28B2RT89 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc22a28B2RT89 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc22a28B2RT89 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc22a28B2RT89 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc22a28B2RT89 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc22a28B2RT89 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc22a28B2RT89 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc22a28B2RT89 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc22a28B2RT89 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc22a28B2RT89 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc22a28B2RT89 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc22a28B2RT89 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc22a28B2RT89 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc22a28B2RT89 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc22a28B2RT89 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc22a28B2RT89 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc22a28B2RT89 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc22a28B2RT89 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc22a28B2RT89 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc22a28B2RT89 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc22a28B2RT89 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc22a28B2RT89 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc22a28B2RT89 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc22a28B2RT89 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slc22a28B2RT89 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slc22a28B2RT89 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slc22a28B2RT89 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slc22a28B2RT89 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slc22a28B2RT89 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slc22a28B2RT89 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slc22a28B2RT89 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slc22a28B2RT89 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slc22a28B2RT89 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slc22a28B2RT89 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms