Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rrn3B2RS91 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rrn3B2RS91 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rrn3B2RS91 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rrn3B2RS91 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rrn3B2RS91 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rrn3B2RS91 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Rrn3B2RS91 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rrn3B2RS91 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rrn3B2RS91 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rrn3B2RS91 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rrn3B2RS91 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rrn3B2RS91 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rrn3B2RS91 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rrn3B2RS91 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Rrn3B2RS91 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rrn3B2RS91 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rrn3B2RS91 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rrn3B2RS91 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Rrn3B2RS91 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rrn3B2RS91 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rrn3B2RS91 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rrn3B2RS91 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rrn3B2RS91 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rrn3B2RS91 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rrn3B2RS91 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rrn3B2RS91 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rrn3B2RS91 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rrn3B2RS91 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rrn3B2RS91 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rrn3B2RS91 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rrn3B2RS91 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rrn3B2RS91 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rrn3B2RS91 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rrn3B2RS91 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rrn3B2RS91 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rrn3B2RS91 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rrn3B2RS91 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rrn3B2RS91 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rrn3B2RS91 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rrn3B2RS91 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rrn3B2RS91 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rrn3B2RS91 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rrn3B2RS91 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rrn3B2RS91 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rrn3B2RS91 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rrn3B2RS91 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Rrn3B2RS91 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Rrn3B2RS91 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rrn3B2RS91 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rrn3B2RS91 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Rrn3B2RS91 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rrn3B2RS91 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Rrn3B2RS91 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rrn3B2RS91 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rrn3B2RS91 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rrn3B2RS91 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rrn3B2RS91 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rrn3B2RS91 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rrn3B2RS91 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rrn3B2RS91 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rrn3B2RS91 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rrn3B2RS91 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rrn3B2RS91 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rrn3B2RS91 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rrn3B2RS91 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rrn3B2RS91 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rrn3B2RS91 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rrn3B2RS91 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Rrn3B2RS91 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rrn3B2RS91 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rrn3B2RS91 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rrn3B2RS91 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rrn3B2RS91 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Rrn3B2RS91 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rrn3B2RS91 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rrn3B2RS91 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rrn3B2RS91 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rrn3B2RS91 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rrn3B2RS91 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rrn3B2RS91 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rrn3B2RS91 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rrn3B2RS91 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rrn3B2RS91 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rrn3B2RS91 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rrn3B2RS91 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rrn3B2RS91 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rrn3B2RS91 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rrn3B2RS91 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rrn3B2RS91 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rrn3B2RS91 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rrn3B2RS91 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rrn3B2RS91 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rrn3B2RS91 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rrn3B2RS91 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rrn3B2RS91 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rrn3B2RS91 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rrn3B2RS91 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rrn3B2RS91 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rrn3B2RS91 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
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