Protein–RNA interactions for Protein: B2RS76

Cpb1, Carboxypeptidase B1 (Tissue), isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpb1B2RS76 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cpb1B2RS76 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cpb1B2RS76 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cpb1B2RS76 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cpb1B2RS76 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cpb1B2RS76 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cpb1B2RS76 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cpb1B2RS76 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cpb1B2RS76 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cpb1B2RS76 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cpb1B2RS76 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cpb1B2RS76 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Cpb1B2RS76 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cpb1B2RS76 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cpb1B2RS76 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cpb1B2RS76 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cpb1B2RS76 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cpb1B2RS76 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cpb1B2RS76 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cpb1B2RS76 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cpb1B2RS76 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cpb1B2RS76 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cpb1B2RS76 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cpb1B2RS76 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cpb1B2RS76 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cpb1B2RS76 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cpb1B2RS76 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cpb1B2RS76 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cpb1B2RS76 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cpb1B2RS76 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cpb1B2RS76 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cpb1B2RS76 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cpb1B2RS76 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cpb1B2RS76 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cpb1B2RS76 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cpb1B2RS76 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cpb1B2RS76 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cpb1B2RS76 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cpb1B2RS76 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cpb1B2RS76 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cpb1B2RS76 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cpb1B2RS76 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cpb1B2RS76 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cpb1B2RS76 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cpb1B2RS76 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Cpb1B2RS76 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cpb1B2RS76 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cpb1B2RS76 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cpb1B2RS76 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cpb1B2RS76 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cpb1B2RS76 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cpb1B2RS76 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cpb1B2RS76 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cpb1B2RS76 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cpb1B2RS76 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cpb1B2RS76 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cpb1B2RS76 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cpb1B2RS76 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cpb1B2RS76 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cpb1B2RS76 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cpb1B2RS76 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cpb1B2RS76 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cpb1B2RS76 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cpb1B2RS76 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cpb1B2RS76 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cpb1B2RS76 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Cpb1B2RS76 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cpb1B2RS76 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cpb1B2RS76 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cpb1B2RS76 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cpb1B2RS76 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cpb1B2RS76 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cpb1B2RS76 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cpb1B2RS76 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cpb1B2RS76 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cpb1B2RS76 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cpb1B2RS76 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cpb1B2RS76 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Cpb1B2RS76 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cpb1B2RS76 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cpb1B2RS76 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Cpb1B2RS76 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cpb1B2RS76 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cpb1B2RS76 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cpb1B2RS76 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cpb1B2RS76 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Cpb1B2RS76 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cpb1B2RS76 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cpb1B2RS76 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cpb1B2RS76 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cpb1B2RS76 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cpb1B2RS76 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cpb1B2RS76 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cpb1B2RS76 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cpb1B2RS76 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cpb1B2RS76 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cpb1B2RS76 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cpb1B2RS76 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Cpb1B2RS76 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cpb1B2RS76 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms