Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE7

Otud4, OTU domain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud4B2RRE7 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Otud4B2RRE7 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Otud4B2RRE7 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Otud4B2RRE7 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Otud4B2RRE7 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Otud4B2RRE7 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Otud4B2RRE7 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Otud4B2RRE7 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Otud4B2RRE7 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Otud4B2RRE7 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Otud4B2RRE7 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Otud4B2RRE7 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Otud4B2RRE7 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Otud4B2RRE7 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Otud4B2RRE7 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Otud4B2RRE7 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Otud4B2RRE7 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Otud4B2RRE7 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Otud4B2RRE7 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Otud4B2RRE7 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Otud4B2RRE7 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Otud4B2RRE7 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Otud4B2RRE7 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Otud4B2RRE7 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Otud4B2RRE7 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Otud4B2RRE7 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Otud4B2RRE7 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Otud4B2RRE7 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Otud4B2RRE7 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Otud4B2RRE7 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Otud4B2RRE7 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Otud4B2RRE7 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Otud4B2RRE7 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Otud4B2RRE7 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Otud4B2RRE7 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Otud4B2RRE7 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Otud4B2RRE7 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Otud4B2RRE7 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Otud4B2RRE7 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Otud4B2RRE7 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Otud4B2RRE7 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Otud4B2RRE7 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Otud4B2RRE7 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Otud4B2RRE7 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Otud4B2RRE7 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Otud4B2RRE7 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Otud4B2RRE7 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Otud4B2RRE7 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Otud4B2RRE7 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Otud4B2RRE7 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Otud4B2RRE7 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Otud4B2RRE7 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Otud4B2RRE7 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Otud4B2RRE7 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Otud4B2RRE7 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Otud4B2RRE7 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Otud4B2RRE7 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Otud4B2RRE7 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Otud4B2RRE7 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Otud4B2RRE7 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Otud4B2RRE7 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Otud4B2RRE7 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Otud4B2RRE7 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Otud4B2RRE7 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Otud4B2RRE7 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Otud4B2RRE7 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Otud4B2RRE7 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Otud4B2RRE7 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Otud4B2RRE7 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Otud4B2RRE7 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Otud4B2RRE7 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Otud4B2RRE7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Otud4B2RRE7 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Otud4B2RRE7 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Otud4B2RRE7 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Otud4B2RRE7 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Otud4B2RRE7 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Otud4B2RRE7 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Otud4B2RRE7 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Otud4B2RRE7 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Otud4B2RRE7 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Otud4B2RRE7 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Otud4B2RRE7 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Otud4B2RRE7 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Otud4B2RRE7 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Otud4B2RRE7 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Otud4B2RRE7 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Otud4B2RRE7 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Otud4B2RRE7 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Otud4B2RRE7 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Otud4B2RRE7 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Otud4B2RRE7 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Otud4B2RRE7 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Otud4B2RRE7 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Otud4B2RRE7 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Otud4B2RRE7 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Otud4B2RRE7 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Otud4B2RRE7 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Otud4B2RRE7 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Otud4B2RRE7 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms