Protein–RNA interactions for Protein: B1AVB3

Scml2, Scm polycomb group protein-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scml2B1AVB3 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scml2B1AVB3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scml2B1AVB3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scml2B1AVB3 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scml2B1AVB3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scml2B1AVB3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scml2B1AVB3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scml2B1AVB3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scml2B1AVB3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scml2B1AVB3 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scml2B1AVB3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scml2B1AVB3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scml2B1AVB3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scml2B1AVB3 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scml2B1AVB3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scml2B1AVB3 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scml2B1AVB3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scml2B1AVB3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scml2B1AVB3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scml2B1AVB3 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scml2B1AVB3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scml2B1AVB3 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scml2B1AVB3 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scml2B1AVB3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scml2B1AVB3 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scml2B1AVB3 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scml2B1AVB3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scml2B1AVB3 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scml2B1AVB3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Scml2B1AVB3 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scml2B1AVB3 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scml2B1AVB3 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scml2B1AVB3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scml2B1AVB3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scml2B1AVB3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scml2B1AVB3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Scml2B1AVB3 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scml2B1AVB3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scml2B1AVB3 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scml2B1AVB3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scml2B1AVB3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scml2B1AVB3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scml2B1AVB3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scml2B1AVB3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scml2B1AVB3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Scml2B1AVB3 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scml2B1AVB3 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scml2B1AVB3 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scml2B1AVB3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scml2B1AVB3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scml2B1AVB3 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scml2B1AVB3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scml2B1AVB3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scml2B1AVB3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scml2B1AVB3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scml2B1AVB3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scml2B1AVB3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scml2B1AVB3 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scml2B1AVB3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scml2B1AVB3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scml2B1AVB3 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scml2B1AVB3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scml2B1AVB3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scml2B1AVB3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scml2B1AVB3 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scml2B1AVB3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scml2B1AVB3 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scml2B1AVB3 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scml2B1AVB3 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scml2B1AVB3 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scml2B1AVB3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scml2B1AVB3 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scml2B1AVB3 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scml2B1AVB3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Scml2B1AVB3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scml2B1AVB3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scml2B1AVB3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scml2B1AVB3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scml2B1AVB3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scml2B1AVB3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scml2B1AVB3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scml2B1AVB3 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Scml2B1AVB3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Scml2B1AVB3 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Scml2B1AVB3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Scml2B1AVB3 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Scml2B1AVB3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scml2B1AVB3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scml2B1AVB3 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scml2B1AVB3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scml2B1AVB3 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scml2B1AVB3 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scml2B1AVB3 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scml2B1AVB3 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scml2B1AVB3 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scml2B1AVB3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scml2B1AVB3 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scml2B1AVB3 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scml2B1AVB3 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scml2B1AVB3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms