Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trabd2bB1ATG9 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trabd2bB1ATG9 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trabd2bB1ATG9 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trabd2bB1ATG9 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trabd2bB1ATG9 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trabd2bB1ATG9 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trabd2bB1ATG9 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trabd2bB1ATG9 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trabd2bB1ATG9 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trabd2bB1ATG9 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trabd2bB1ATG9 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trabd2bB1ATG9 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trabd2bB1ATG9 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trabd2bB1ATG9 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trabd2bB1ATG9 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trabd2bB1ATG9 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trabd2bB1ATG9 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trabd2bB1ATG9 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trabd2bB1ATG9 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Trabd2bB1ATG9 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trabd2bB1ATG9 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trabd2bB1ATG9 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trabd2bB1ATG9 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trabd2bB1ATG9 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trabd2bB1ATG9 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trabd2bB1ATG9 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trabd2bB1ATG9 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Trabd2bB1ATG9 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trabd2bB1ATG9 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trabd2bB1ATG9 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trabd2bB1ATG9 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trabd2bB1ATG9 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trabd2bB1ATG9 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trabd2bB1ATG9 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Trabd2bB1ATG9 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Trabd2bB1ATG9 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trabd2bB1ATG9 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trabd2bB1ATG9 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trabd2bB1ATG9 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trabd2bB1ATG9 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trabd2bB1ATG9 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trabd2bB1ATG9 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trabd2bB1ATG9 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trabd2bB1ATG9 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trabd2bB1ATG9 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trabd2bB1ATG9 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trabd2bB1ATG9 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trabd2bB1ATG9 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trabd2bB1ATG9 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trabd2bB1ATG9 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trabd2bB1ATG9 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trabd2bB1ATG9 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trabd2bB1ATG9 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trabd2bB1ATG9 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trabd2bB1ATG9 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trabd2bB1ATG9 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Trabd2bB1ATG9 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trabd2bB1ATG9 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trabd2bB1ATG9 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trabd2bB1ATG9 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trabd2bB1ATG9 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trabd2bB1ATG9 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Trabd2bB1ATG9 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trabd2bB1ATG9 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trabd2bB1ATG9 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trabd2bB1ATG9 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trabd2bB1ATG9 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trabd2bB1ATG9 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trabd2bB1ATG9 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trabd2bB1ATG9 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trabd2bB1ATG9 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trabd2bB1ATG9 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trabd2bB1ATG9 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trabd2bB1ATG9 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trabd2bB1ATG9 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trabd2bB1ATG9 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trabd2bB1ATG9 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trabd2bB1ATG9 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trabd2bB1ATG9 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trabd2bB1ATG9 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trabd2bB1ATG9 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trabd2bB1ATG9 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Trabd2bB1ATG9 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trabd2bB1ATG9 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Trabd2bB1ATG9 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trabd2bB1ATG9 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trabd2bB1ATG9 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trabd2bB1ATG9 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trabd2bB1ATG9 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trabd2bB1ATG9 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trabd2bB1ATG9 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trabd2bB1ATG9 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trabd2bB1ATG9 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trabd2bB1ATG9 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trabd2bB1ATG9 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trabd2bB1ATG9 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trabd2bB1ATG9 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trabd2bB1ATG9 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trabd2bB1ATG9 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
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