Protein–RNA interactions for Protein: B1AT01

1700084M14Rik, RIKEN cDNA 1700084M14 gene, mousemouse

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700084M14RikB1AT01 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700084M14RikB1AT01 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700084M14RikB1AT01 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700084M14RikB1AT01 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700084M14RikB1AT01 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700084M14RikB1AT01 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700084M14RikB1AT01 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700084M14RikB1AT01 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700084M14RikB1AT01 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700084M14RikB1AT01 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700084M14RikB1AT01 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700084M14RikB1AT01 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
1700084M14RikB1AT01 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700084M14RikB1AT01 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700084M14RikB1AT01 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700084M14RikB1AT01 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700084M14RikB1AT01 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
1700084M14RikB1AT01 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700084M14RikB1AT01 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700084M14RikB1AT01 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700084M14RikB1AT01 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700084M14RikB1AT01 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700084M14RikB1AT01 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700084M14RikB1AT01 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700084M14RikB1AT01 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700084M14RikB1AT01 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700084M14RikB1AT01 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700084M14RikB1AT01 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700084M14RikB1AT01 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700084M14RikB1AT01 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700084M14RikB1AT01 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
1700084M14RikB1AT01 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700084M14RikB1AT01 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700084M14RikB1AT01 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
1700084M14RikB1AT01 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700084M14RikB1AT01 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700084M14RikB1AT01 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700084M14RikB1AT01 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700084M14RikB1AT01 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700084M14RikB1AT01 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700084M14RikB1AT01 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700084M14RikB1AT01 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700084M14RikB1AT01 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700084M14RikB1AT01 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700084M14RikB1AT01 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
1700084M14RikB1AT01 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700084M14RikB1AT01 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700084M14RikB1AT01 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700084M14RikB1AT01 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700084M14RikB1AT01 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700084M14RikB1AT01 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700084M14RikB1AT01 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700084M14RikB1AT01 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700084M14RikB1AT01 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700084M14RikB1AT01 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700084M14RikB1AT01 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700084M14RikB1AT01 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
1700084M14RikB1AT01 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
1700084M14RikB1AT01 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
1700084M14RikB1AT01 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700084M14RikB1AT01 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700084M14RikB1AT01 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700084M14RikB1AT01 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700084M14RikB1AT01 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700084M14RikB1AT01 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700084M14RikB1AT01 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700084M14RikB1AT01 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700084M14RikB1AT01 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700084M14RikB1AT01 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700084M14RikB1AT01 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700084M14RikB1AT01 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700084M14RikB1AT01 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700084M14RikB1AT01 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700084M14RikB1AT01 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700084M14RikB1AT01 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700084M14RikB1AT01 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700084M14RikB1AT01 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700084M14RikB1AT01 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700084M14RikB1AT01 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700084M14RikB1AT01 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700084M14RikB1AT01 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700084M14RikB1AT01 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700084M14RikB1AT01 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700084M14RikB1AT01 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700084M14RikB1AT01 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700084M14RikB1AT01 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700084M14RikB1AT01 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700084M14RikB1AT01 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700084M14RikB1AT01 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700084M14RikB1AT01 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700084M14RikB1AT01 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700084M14RikB1AT01 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700084M14RikB1AT01 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700084M14RikB1AT01 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700084M14RikB1AT01 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700084M14RikB1AT01 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
1700084M14RikB1AT01 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700084M14RikB1AT01 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700084M14RikB1AT01 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700084M14RikB1AT01 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms