Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Spocd1B1ASB6 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Spocd1B1ASB6 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Spocd1B1ASB6 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Spocd1B1ASB6 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Spocd1B1ASB6 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Spocd1B1ASB6 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Spocd1B1ASB6 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Spocd1B1ASB6 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Spocd1B1ASB6 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Spocd1B1ASB6 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Spocd1B1ASB6 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Spocd1B1ASB6 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Spocd1B1ASB6 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Spocd1B1ASB6 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Spocd1B1ASB6 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Spocd1B1ASB6 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Spocd1B1ASB6 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Spocd1B1ASB6 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Spocd1B1ASB6 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Spocd1B1ASB6 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Spocd1B1ASB6 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Spocd1B1ASB6 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Spocd1B1ASB6 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Spocd1B1ASB6 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Spocd1B1ASB6 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Spocd1B1ASB6 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Spocd1B1ASB6 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Spocd1B1ASB6 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Spocd1B1ASB6 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Spocd1B1ASB6 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Spocd1B1ASB6 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Spocd1B1ASB6 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Spocd1B1ASB6 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Spocd1B1ASB6 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Spocd1B1ASB6 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Spocd1B1ASB6 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Spocd1B1ASB6 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Spocd1B1ASB6 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Spocd1B1ASB6 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Spocd1B1ASB6 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Spocd1B1ASB6 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Spocd1B1ASB6 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Spocd1B1ASB6 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Spocd1B1ASB6 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Spocd1B1ASB6 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Spocd1B1ASB6 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Spocd1B1ASB6 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Spocd1B1ASB6 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Spocd1B1ASB6 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Spocd1B1ASB6 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Spocd1B1ASB6 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Spocd1B1ASB6 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Spocd1B1ASB6 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Spocd1B1ASB6 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Spocd1B1ASB6 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Spocd1B1ASB6 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Spocd1B1ASB6 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Spocd1B1ASB6 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Spocd1B1ASB6 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Spocd1B1ASB6 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Spocd1B1ASB6 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Spocd1B1ASB6 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Spocd1B1ASB6 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Spocd1B1ASB6 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Spocd1B1ASB6 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Spocd1B1ASB6 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Spocd1B1ASB6 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Spocd1B1ASB6 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Spocd1B1ASB6 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Spocd1B1ASB6 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Spocd1B1ASB6 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Spocd1B1ASB6 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Spocd1B1ASB6 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Spocd1B1ASB6 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Spocd1B1ASB6 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Spocd1B1ASB6 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Spocd1B1ASB6 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Spocd1B1ASB6 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Spocd1B1ASB6 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Spocd1B1ASB6 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Spocd1B1ASB6 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Spocd1B1ASB6 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Spocd1B1ASB6 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Spocd1B1ASB6 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Spocd1B1ASB6 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Spocd1B1ASB6 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Spocd1B1ASB6 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Spocd1B1ASB6 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Spocd1B1ASB6 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Spocd1B1ASB6 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Spocd1B1ASB6 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Spocd1B1ASB6 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Spocd1B1ASB6 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Spocd1B1ASB6 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Spocd1B1ASB6 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Spocd1B1ASB6 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Spocd1B1ASB6 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Spocd1B1ASB6 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Spocd1B1ASB6 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms