Protein–RNA interactions for Protein: B0V2N1

Ptprs, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, mousemouse

Predictions only

Length 1,907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprsB0V2N1 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtprsB0V2N1 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtprsB0V2N1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PtprsB0V2N1 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtprsB0V2N1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PtprsB0V2N1 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PtprsB0V2N1 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PtprsB0V2N1 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PtprsB0V2N1 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PtprsB0V2N1 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PtprsB0V2N1 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PtprsB0V2N1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PtprsB0V2N1 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PtprsB0V2N1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PtprsB0V2N1 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PtprsB0V2N1 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PtprsB0V2N1 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PtprsB0V2N1 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PtprsB0V2N1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PtprsB0V2N1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PtprsB0V2N1 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PtprsB0V2N1 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PtprsB0V2N1 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtprsB0V2N1 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtprsB0V2N1 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtprsB0V2N1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtprsB0V2N1 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtprsB0V2N1 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtprsB0V2N1 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtprsB0V2N1 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtprsB0V2N1 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PtprsB0V2N1 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtprsB0V2N1 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtprsB0V2N1 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtprsB0V2N1 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtprsB0V2N1 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtprsB0V2N1 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtprsB0V2N1 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtprsB0V2N1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtprsB0V2N1 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtprsB0V2N1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PtprsB0V2N1 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PtprsB0V2N1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PtprsB0V2N1 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PtprsB0V2N1 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PtprsB0V2N1 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PtprsB0V2N1 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PtprsB0V2N1 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PtprsB0V2N1 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PtprsB0V2N1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
PtprsB0V2N1 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PtprsB0V2N1 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PtprsB0V2N1 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PtprsB0V2N1 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PtprsB0V2N1 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PtprsB0V2N1 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PtprsB0V2N1 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PtprsB0V2N1 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtprsB0V2N1 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtprsB0V2N1 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtprsB0V2N1 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtprsB0V2N1 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtprsB0V2N1 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtprsB0V2N1 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtprsB0V2N1 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtprsB0V2N1 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtprsB0V2N1 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtprsB0V2N1 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtprsB0V2N1 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtprsB0V2N1 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtprsB0V2N1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtprsB0V2N1 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtprsB0V2N1 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtprsB0V2N1 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtprsB0V2N1 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtprsB0V2N1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtprsB0V2N1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtprsB0V2N1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtprsB0V2N1 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtprsB0V2N1 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PtprsB0V2N1 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtprsB0V2N1 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtprsB0V2N1 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtprsB0V2N1 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtprsB0V2N1 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtprsB0V2N1 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtprsB0V2N1 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtprsB0V2N1 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtprsB0V2N1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PtprsB0V2N1 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtprsB0V2N1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtprsB0V2N1 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtprsB0V2N1 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtprsB0V2N1 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtprsB0V2N1 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtprsB0V2N1 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtprsB0V2N1 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtprsB0V2N1 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PtprsB0V2N1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtprsB0V2N1 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms