Protein–RNA interactions for Protein: A7XUY5

Skint5, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint5A7XUY5 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Skint5A7XUY5 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Skint5A7XUY5 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Skint5A7XUY5 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Skint5A7XUY5 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Skint5A7XUY5 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Skint5A7XUY5 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Skint5A7XUY5 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Skint5A7XUY5 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Skint5A7XUY5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Skint5A7XUY5 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Skint5A7XUY5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Skint5A7XUY5 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Skint5A7XUY5 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Skint5A7XUY5 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Skint5A7XUY5 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Skint5A7XUY5 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Skint5A7XUY5 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Skint5A7XUY5 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Skint5A7XUY5 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Skint5A7XUY5 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Skint5A7XUY5 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Skint5A7XUY5 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Skint5A7XUY5 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Skint5A7XUY5 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Skint5A7XUY5 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Skint5A7XUY5 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Skint5A7XUY5 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Skint5A7XUY5 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Skint5A7XUY5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Skint5A7XUY5 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Skint5A7XUY5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Skint5A7XUY5 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Skint5A7XUY5 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Skint5A7XUY5 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Skint5A7XUY5 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Skint5A7XUY5 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Skint5A7XUY5 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Skint5A7XUY5 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Skint5A7XUY5 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Skint5A7XUY5 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Skint5A7XUY5 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Skint5A7XUY5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Skint5A7XUY5 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Skint5A7XUY5 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Skint5A7XUY5 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Skint5A7XUY5 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Skint5A7XUY5 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Skint5A7XUY5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Skint5A7XUY5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Skint5A7XUY5 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Skint5A7XUY5 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Skint5A7XUY5 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Skint5A7XUY5 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Skint5A7XUY5 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Skint5A7XUY5 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Skint5A7XUY5 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Skint5A7XUY5 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Skint5A7XUY5 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Skint5A7XUY5 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Skint5A7XUY5 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Skint5A7XUY5 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Skint5A7XUY5 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Skint5A7XUY5 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Skint5A7XUY5 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Skint5A7XUY5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Skint5A7XUY5 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Skint5A7XUY5 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Skint5A7XUY5 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Skint5A7XUY5 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Skint5A7XUY5 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Skint5A7XUY5 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Skint5A7XUY5 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Skint5A7XUY5 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Skint5A7XUY5 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Skint5A7XUY5 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Skint5A7XUY5 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Skint5A7XUY5 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Skint5A7XUY5 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Skint5A7XUY5 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Skint5A7XUY5 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Skint5A7XUY5 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Skint5A7XUY5 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Skint5A7XUY5 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Skint5A7XUY5 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Skint5A7XUY5 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Skint5A7XUY5 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Skint5A7XUY5 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Skint5A7XUY5 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Skint5A7XUY5 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Skint5A7XUY5 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Skint5A7XUY5 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Skint5A7XUY5 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Skint5A7XUY5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Skint5A7XUY5 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Skint5A7XUY5 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Skint5A7XUY5 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Skint5A7XUY5 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Skint5A7XUY5 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Skint5A7XUY5 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms