Protein–RNA interactions for Protein: A7XUX6

Skint2, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint2A7XUX6 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Skint2A7XUX6 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Skint2A7XUX6 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Skint2A7XUX6 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Skint2A7XUX6 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Skint2A7XUX6 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Skint2A7XUX6 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Skint2A7XUX6 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Skint2A7XUX6 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Skint2A7XUX6 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Skint2A7XUX6 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Skint2A7XUX6 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Skint2A7XUX6 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Skint2A7XUX6 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Skint2A7XUX6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Skint2A7XUX6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Skint2A7XUX6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Skint2A7XUX6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Skint2A7XUX6 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Skint2A7XUX6 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Skint2A7XUX6 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Skint2A7XUX6 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Skint2A7XUX6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Skint2A7XUX6 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Skint2A7XUX6 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Skint2A7XUX6 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Skint2A7XUX6 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Skint2A7XUX6 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Skint2A7XUX6 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Skint2A7XUX6 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Skint2A7XUX6 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Skint2A7XUX6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Skint2A7XUX6 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Skint2A7XUX6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Skint2A7XUX6 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Skint2A7XUX6 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Skint2A7XUX6 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Skint2A7XUX6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Skint2A7XUX6 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Skint2A7XUX6 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Skint2A7XUX6 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Skint2A7XUX6 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Skint2A7XUX6 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Skint2A7XUX6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Skint2A7XUX6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Skint2A7XUX6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Skint2A7XUX6 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Skint2A7XUX6 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Skint2A7XUX6 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Skint2A7XUX6 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Skint2A7XUX6 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Skint2A7XUX6 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Skint2A7XUX6 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Skint2A7XUX6 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Skint2A7XUX6 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Skint2A7XUX6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Skint2A7XUX6 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Skint2A7XUX6 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Skint2A7XUX6 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Skint2A7XUX6 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Skint2A7XUX6 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Skint2A7XUX6 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Skint2A7XUX6 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Skint2A7XUX6 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Skint2A7XUX6 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Skint2A7XUX6 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Skint2A7XUX6 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Skint2A7XUX6 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Skint2A7XUX6 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Skint2A7XUX6 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Skint2A7XUX6 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Skint2A7XUX6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Skint2A7XUX6 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Skint2A7XUX6 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Skint2A7XUX6 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Skint2A7XUX6 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Skint2A7XUX6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Skint2A7XUX6 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Skint2A7XUX6 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Skint2A7XUX6 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Skint2A7XUX6 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Skint2A7XUX6 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Skint2A7XUX6 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Skint2A7XUX6 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Skint2A7XUX6 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Skint2A7XUX6 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Skint2A7XUX6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Skint2A7XUX6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Skint2A7XUX6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Skint2A7XUX6 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Skint2A7XUX6 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Skint2A7XUX6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Skint2A7XUX6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Skint2A7XUX6 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Skint2A7XUX6 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Skint2A7XUX6 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Skint2A7XUX6 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Skint2A7XUX6 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Skint2A7XUX6 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Skint2A7XUX6 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms