Protein–RNA interactions for Protein: A6X8Z9

4930435E12Rik, RIKEN cDNA 4930435E12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930435E12RikA6X8Z9 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
4930435E12RikA6X8Z9 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
4930435E12RikA6X8Z9 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930435E12RikA6X8Z9 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930435E12RikA6X8Z9 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930435E12RikA6X8Z9 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930435E12RikA6X8Z9 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms