Protein–RNA interactions for Protein: A4UUI3

Gbp4, Guanylate binding protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp4A4UUI3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbp4A4UUI3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbp4A4UUI3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbp4A4UUI3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbp4A4UUI3 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbp4A4UUI3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbp4A4UUI3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbp4A4UUI3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gbp4A4UUI3 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gbp4A4UUI3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gbp4A4UUI3 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gbp4A4UUI3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gbp4A4UUI3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gbp4A4UUI3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gbp4A4UUI3 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gbp4A4UUI3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gbp4A4UUI3 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gbp4A4UUI3 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gbp4A4UUI3 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gbp4A4UUI3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gbp4A4UUI3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gbp4A4UUI3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gbp4A4UUI3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gbp4A4UUI3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gbp4A4UUI3 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gbp4A4UUI3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gbp4A4UUI3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gbp4A4UUI3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gbp4A4UUI3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gbp4A4UUI3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gbp4A4UUI3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gbp4A4UUI3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gbp4A4UUI3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gbp4A4UUI3 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gbp4A4UUI3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gbp4A4UUI3 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gbp4A4UUI3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gbp4A4UUI3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gbp4A4UUI3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gbp4A4UUI3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gbp4A4UUI3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gbp4A4UUI3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gbp4A4UUI3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gbp4A4UUI3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gbp4A4UUI3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gbp4A4UUI3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gbp4A4UUI3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gbp4A4UUI3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gbp4A4UUI3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gbp4A4UUI3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gbp4A4UUI3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Gbp4A4UUI3 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Gbp4A4UUI3 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Gbp4A4UUI3 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Gbp4A4UUI3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gbp4A4UUI3 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Gbp4A4UUI3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gbp4A4UUI3 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Gbp4A4UUI3 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Gbp4A4UUI3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gbp4A4UUI3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gbp4A4UUI3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gbp4A4UUI3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gbp4A4UUI3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gbp4A4UUI3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gbp4A4UUI3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gbp4A4UUI3 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Gbp4A4UUI3 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gbp4A4UUI3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gbp4A4UUI3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gbp4A4UUI3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gbp4A4UUI3 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gbp4A4UUI3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gbp4A4UUI3 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gbp4A4UUI3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gbp4A4UUI3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gbp4A4UUI3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gbp4A4UUI3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gbp4A4UUI3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gbp4A4UUI3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gbp4A4UUI3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gbp4A4UUI3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gbp4A4UUI3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gbp4A4UUI3 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gbp4A4UUI3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gbp4A4UUI3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gbp4A4UUI3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gbp4A4UUI3 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gbp4A4UUI3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gbp4A4UUI3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gbp4A4UUI3 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gbp4A4UUI3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gbp4A4UUI3 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gbp4A4UUI3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gbp4A4UUI3 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Gbp4A4UUI3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gbp4A4UUI3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gbp4A4UUI3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gbp4A4UUI3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gbp4A4UUI3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms