Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Odf2A3KGV1 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Odf2A3KGV1 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Odf2A3KGV1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Odf2A3KGV1 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Odf2A3KGV1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Odf2A3KGV1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Odf2A3KGV1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Odf2A3KGV1 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Odf2A3KGV1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Odf2A3KGV1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Odf2A3KGV1 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Odf2A3KGV1 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Odf2A3KGV1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Odf2A3KGV1 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Odf2A3KGV1 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Odf2A3KGV1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Odf2A3KGV1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Odf2A3KGV1 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Odf2A3KGV1 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Odf2A3KGV1 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Odf2A3KGV1 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Odf2A3KGV1 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Odf2A3KGV1 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Odf2A3KGV1 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Odf2A3KGV1 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Odf2A3KGV1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Odf2A3KGV1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Odf2A3KGV1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Odf2A3KGV1 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Odf2A3KGV1 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Odf2A3KGV1 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Odf2A3KGV1 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Odf2A3KGV1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Odf2A3KGV1 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Odf2A3KGV1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Odf2A3KGV1 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Odf2A3KGV1 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Odf2A3KGV1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Odf2A3KGV1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Odf2A3KGV1 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Odf2A3KGV1 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Odf2A3KGV1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Odf2A3KGV1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Odf2A3KGV1 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Odf2A3KGV1 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Odf2A3KGV1 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Odf2A3KGV1 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Odf2A3KGV1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Odf2A3KGV1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Odf2A3KGV1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Odf2A3KGV1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Odf2A3KGV1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Odf2A3KGV1 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Odf2A3KGV1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Odf2A3KGV1 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Odf2A3KGV1 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Odf2A3KGV1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Odf2A3KGV1 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Odf2A3KGV1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Odf2A3KGV1 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Odf2A3KGV1 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Odf2A3KGV1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Odf2A3KGV1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Odf2A3KGV1 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Odf2A3KGV1 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Odf2A3KGV1 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Odf2A3KGV1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Odf2A3KGV1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Odf2A3KGV1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Odf2A3KGV1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Odf2A3KGV1 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Odf2A3KGV1 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Odf2A3KGV1 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Odf2A3KGV1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Odf2A3KGV1 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Odf2A3KGV1 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Odf2A3KGV1 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Odf2A3KGV1 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Odf2A3KGV1 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Odf2A3KGV1 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Odf2A3KGV1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Odf2A3KGV1 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Odf2A3KGV1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Odf2A3KGV1 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Odf2A3KGV1 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Odf2A3KGV1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Odf2A3KGV1 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Odf2A3KGV1 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Odf2A3KGV1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Odf2A3KGV1 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Odf2A3KGV1 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Odf2A3KGV1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Odf2A3KGV1 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Odf2A3KGV1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Odf2A3KGV1 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Odf2A3KGV1 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Odf2A3KGV1 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Odf2A3KGV1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Odf2A3KGV1 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms