Protein–RNA interactions for Protein: A2BI40

Xlr4a, X-linked lymphocyte-regulated 4A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xlr4aA2BI40 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Xlr4aA2BI40 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Xlr4aA2BI40 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Xlr4aA2BI40 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Xlr4aA2BI40 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Xlr4aA2BI40 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Xlr4aA2BI40 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Xlr4aA2BI40 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Xlr4aA2BI40 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Xlr4aA2BI40 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Xlr4aA2BI40 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Xlr4aA2BI40 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Xlr4aA2BI40 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Xlr4aA2BI40 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Xlr4aA2BI40 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Xlr4aA2BI40 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Xlr4aA2BI40 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Xlr4aA2BI40 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Xlr4aA2BI40 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Xlr4aA2BI40 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Xlr4aA2BI40 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Xlr4aA2BI40 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Xlr4aA2BI40 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Xlr4aA2BI40 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Xlr4aA2BI40 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Xlr4aA2BI40 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Xlr4aA2BI40 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Xlr4aA2BI40 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Xlr4aA2BI40 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Xlr4aA2BI40 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Xlr4aA2BI40 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Xlr4aA2BI40 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Xlr4aA2BI40 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Xlr4aA2BI40 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Xlr4aA2BI40 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Xlr4aA2BI40 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Xlr4aA2BI40 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Xlr4aA2BI40 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Xlr4aA2BI40 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Xlr4aA2BI40 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Xlr4aA2BI40 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Xlr4aA2BI40 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Xlr4aA2BI40 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Xlr4aA2BI40 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Xlr4aA2BI40 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Xlr4aA2BI40 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Xlr4aA2BI40 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Xlr4aA2BI40 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Xlr4aA2BI40 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Xlr4aA2BI40 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Xlr4aA2BI40 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Xlr4aA2BI40 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Xlr4aA2BI40 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Xlr4aA2BI40 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Xlr4aA2BI40 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Xlr4aA2BI40 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Xlr4aA2BI40 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Xlr4aA2BI40 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Xlr4aA2BI40 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Xlr4aA2BI40 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Xlr4aA2BI40 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Xlr4aA2BI40 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Xlr4aA2BI40 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Xlr4aA2BI40 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Xlr4aA2BI40 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Xlr4aA2BI40 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Xlr4aA2BI40 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Xlr4aA2BI40 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Xlr4aA2BI40 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Xlr4aA2BI40 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Xlr4aA2BI40 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Xlr4aA2BI40 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Xlr4aA2BI40 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Xlr4aA2BI40 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Xlr4aA2BI40 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Xlr4aA2BI40 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Xlr4aA2BI40 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Xlr4aA2BI40 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Xlr4aA2BI40 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Xlr4aA2BI40 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Xlr4aA2BI40 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Xlr4aA2BI40 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Xlr4aA2BI40 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Xlr4aA2BI40 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Xlr4aA2BI40 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Xlr4aA2BI40 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Xlr4aA2BI40 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Xlr4aA2BI40 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Xlr4aA2BI40 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Xlr4aA2BI40 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Xlr4aA2BI40 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Xlr4aA2BI40 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Xlr4aA2BI40 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Xlr4aA2BI40 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Xlr4aA2BI40 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Xlr4aA2BI40 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Xlr4aA2BI40 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Xlr4aA2BI40 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Xlr4aA2BI40 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Xlr4aA2BI40 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms