Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI9

Pramef25, PRAME family member 25, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef25A2ASI9 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pramef25A2ASI9 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pramef25A2ASI9 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pramef25A2ASI9 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pramef25A2ASI9 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pramef25A2ASI9 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pramef25A2ASI9 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pramef25A2ASI9 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pramef25A2ASI9 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pramef25A2ASI9 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pramef25A2ASI9 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pramef25A2ASI9 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pramef25A2ASI9 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pramef25A2ASI9 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pramef25A2ASI9 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pramef25A2ASI9 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pramef25A2ASI9 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pramef25A2ASI9 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pramef25A2ASI9 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pramef25A2ASI9 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pramef25A2ASI9 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pramef25A2ASI9 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pramef25A2ASI9 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pramef25A2ASI9 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pramef25A2ASI9 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pramef25A2ASI9 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pramef25A2ASI9 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pramef25A2ASI9 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pramef25A2ASI9 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pramef25A2ASI9 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pramef25A2ASI9 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pramef25A2ASI9 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pramef25A2ASI9 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pramef25A2ASI9 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pramef25A2ASI9 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pramef25A2ASI9 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pramef25A2ASI9 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pramef25A2ASI9 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pramef25A2ASI9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pramef25A2ASI9 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pramef25A2ASI9 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pramef25A2ASI9 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pramef25A2ASI9 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pramef25A2ASI9 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pramef25A2ASI9 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pramef25A2ASI9 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pramef25A2ASI9 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pramef25A2ASI9 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pramef25A2ASI9 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pramef25A2ASI9 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pramef25A2ASI9 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pramef25A2ASI9 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pramef25A2ASI9 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pramef25A2ASI9 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pramef25A2ASI9 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pramef25A2ASI9 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pramef25A2ASI9 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pramef25A2ASI9 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pramef25A2ASI9 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pramef25A2ASI9 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Pramef25A2ASI9 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Pramef25A2ASI9 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pramef25A2ASI9 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pramef25A2ASI9 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pramef25A2ASI9 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pramef25A2ASI9 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pramef25A2ASI9 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pramef25A2ASI9 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pramef25A2ASI9 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pramef25A2ASI9 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pramef25A2ASI9 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pramef25A2ASI9 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pramef25A2ASI9 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pramef25A2ASI9 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pramef25A2ASI9 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pramef25A2ASI9 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pramef25A2ASI9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pramef25A2ASI9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pramef25A2ASI9 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pramef25A2ASI9 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pramef25A2ASI9 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pramef25A2ASI9 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pramef25A2ASI9 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pramef25A2ASI9 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pramef25A2ASI9 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pramef25A2ASI9 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pramef25A2ASI9 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pramef25A2ASI9 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pramef25A2ASI9 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pramef25A2ASI9 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pramef25A2ASI9 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pramef25A2ASI9 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pramef25A2ASI9 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pramef25A2ASI9 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pramef25A2ASI9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pramef25A2ASI9 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pramef25A2ASI9 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pramef25A2ASI9 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Pramef25A2ASI9 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pramef25A2ASI9 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms