Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rtf1A2AQ19 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rtf1A2AQ19 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rtf1A2AQ19 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rtf1A2AQ19 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Rtf1A2AQ19 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rtf1A2AQ19 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rtf1A2AQ19 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rtf1A2AQ19 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rtf1A2AQ19 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rtf1A2AQ19 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rtf1A2AQ19 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rtf1A2AQ19 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rtf1A2AQ19 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rtf1A2AQ19 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rtf1A2AQ19 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rtf1A2AQ19 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rtf1A2AQ19 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rtf1A2AQ19 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Rtf1A2AQ19 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rtf1A2AQ19 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rtf1A2AQ19 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rtf1A2AQ19 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rtf1A2AQ19 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Rtf1A2AQ19 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rtf1A2AQ19 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rtf1A2AQ19 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rtf1A2AQ19 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rtf1A2AQ19 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Rtf1A2AQ19 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rtf1A2AQ19 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rtf1A2AQ19 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rtf1A2AQ19 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rtf1A2AQ19 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rtf1A2AQ19 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rtf1A2AQ19 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rtf1A2AQ19 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Rtf1A2AQ19 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rtf1A2AQ19 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rtf1A2AQ19 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rtf1A2AQ19 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rtf1A2AQ19 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rtf1A2AQ19 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rtf1A2AQ19 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rtf1A2AQ19 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rtf1A2AQ19 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Rtf1A2AQ19 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rtf1A2AQ19 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rtf1A2AQ19 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rtf1A2AQ19 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rtf1A2AQ19 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Rtf1A2AQ19 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rtf1A2AQ19 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rtf1A2AQ19 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rtf1A2AQ19 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rtf1A2AQ19 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Rtf1A2AQ19 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rtf1A2AQ19 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rtf1A2AQ19 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Rtf1A2AQ19 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rtf1A2AQ19 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rtf1A2AQ19 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rtf1A2AQ19 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rtf1A2AQ19 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rtf1A2AQ19 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rtf1A2AQ19 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rtf1A2AQ19 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rtf1A2AQ19 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rtf1A2AQ19 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Rtf1A2AQ19 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Rtf1A2AQ19 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rtf1A2AQ19 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rtf1A2AQ19 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rtf1A2AQ19 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rtf1A2AQ19 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rtf1A2AQ19 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rtf1A2AQ19 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rtf1A2AQ19 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rtf1A2AQ19 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rtf1A2AQ19 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rtf1A2AQ19 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rtf1A2AQ19 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rtf1A2AQ19 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rtf1A2AQ19 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rtf1A2AQ19 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Rtf1A2AQ19 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Rtf1A2AQ19 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rtf1A2AQ19 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rtf1A2AQ19 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rtf1A2AQ19 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rtf1A2AQ19 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Rtf1A2AQ19 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rtf1A2AQ19 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rtf1A2AQ19 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rtf1A2AQ19 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rtf1A2AQ19 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rtf1A2AQ19 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rtf1A2AQ19 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rtf1A2AQ19 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rtf1A2AQ19 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
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