Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CtcflA2APF3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CtcflA2APF3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CtcflA2APF3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CtcflA2APF3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CtcflA2APF3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CtcflA2APF3 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CtcflA2APF3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CtcflA2APF3 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtcflA2APF3 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtcflA2APF3 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtcflA2APF3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtcflA2APF3 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtcflA2APF3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtcflA2APF3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtcflA2APF3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtcflA2APF3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtcflA2APF3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CtcflA2APF3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtcflA2APF3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CtcflA2APF3 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CtcflA2APF3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtcflA2APF3 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtcflA2APF3 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtcflA2APF3 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtcflA2APF3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtcflA2APF3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtcflA2APF3 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtcflA2APF3 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtcflA2APF3 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtcflA2APF3 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtcflA2APF3 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtcflA2APF3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CtcflA2APF3 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtcflA2APF3 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtcflA2APF3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtcflA2APF3 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtcflA2APF3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtcflA2APF3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtcflA2APF3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtcflA2APF3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtcflA2APF3 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtcflA2APF3 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtcflA2APF3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtcflA2APF3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtcflA2APF3 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtcflA2APF3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtcflA2APF3 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtcflA2APF3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtcflA2APF3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CtcflA2APF3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtcflA2APF3 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtcflA2APF3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtcflA2APF3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtcflA2APF3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtcflA2APF3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtcflA2APF3 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtcflA2APF3 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtcflA2APF3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtcflA2APF3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtcflA2APF3 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtcflA2APF3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtcflA2APF3 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtcflA2APF3 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtcflA2APF3 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtcflA2APF3 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtcflA2APF3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtcflA2APF3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CtcflA2APF3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtcflA2APF3 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtcflA2APF3 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtcflA2APF3 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtcflA2APF3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtcflA2APF3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtcflA2APF3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtcflA2APF3 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtcflA2APF3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtcflA2APF3 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtcflA2APF3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtcflA2APF3 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtcflA2APF3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtcflA2APF3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtcflA2APF3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtcflA2APF3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtcflA2APF3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtcflA2APF3 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CtcflA2APF3 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtcflA2APF3 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtcflA2APF3 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtcflA2APF3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
CtcflA2APF3 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
CtcflA2APF3 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
CtcflA2APF3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtcflA2APF3 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtcflA2APF3 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtcflA2APF3 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtcflA2APF3 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtcflA2APF3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtcflA2APF3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtcflA2APF3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
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