Protein–RNA interactions for Protein: A2AMW3

Gabre, Gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabreA2AMW3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GabreA2AMW3 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GabreA2AMW3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GabreA2AMW3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GabreA2AMW3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GabreA2AMW3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GabreA2AMW3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GabreA2AMW3 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GabreA2AMW3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GabreA2AMW3 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GabreA2AMW3 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GabreA2AMW3 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GabreA2AMW3 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GabreA2AMW3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GabreA2AMW3 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GabreA2AMW3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GabreA2AMW3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GabreA2AMW3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GabreA2AMW3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GabreA2AMW3 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GabreA2AMW3 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GabreA2AMW3 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GabreA2AMW3 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GabreA2AMW3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GabreA2AMW3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GabreA2AMW3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GabreA2AMW3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GabreA2AMW3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GabreA2AMW3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GabreA2AMW3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GabreA2AMW3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GabreA2AMW3 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GabreA2AMW3 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GabreA2AMW3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GabreA2AMW3 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GabreA2AMW3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
GabreA2AMW3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GabreA2AMW3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GabreA2AMW3 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GabreA2AMW3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GabreA2AMW3 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GabreA2AMW3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GabreA2AMW3 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GabreA2AMW3 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GabreA2AMW3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GabreA2AMW3 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GabreA2AMW3 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GabreA2AMW3 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GabreA2AMW3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GabreA2AMW3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GabreA2AMW3 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GabreA2AMW3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GabreA2AMW3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GabreA2AMW3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GabreA2AMW3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GabreA2AMW3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GabreA2AMW3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GabreA2AMW3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GabreA2AMW3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GabreA2AMW3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GabreA2AMW3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GabreA2AMW3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GabreA2AMW3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GabreA2AMW3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GabreA2AMW3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GabreA2AMW3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GabreA2AMW3 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GabreA2AMW3 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GabreA2AMW3 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GabreA2AMW3 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GabreA2AMW3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GabreA2AMW3 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GabreA2AMW3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GabreA2AMW3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GabreA2AMW3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GabreA2AMW3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GabreA2AMW3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GabreA2AMW3 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GabreA2AMW3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GabreA2AMW3 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GabreA2AMW3 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GabreA2AMW3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GabreA2AMW3 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GabreA2AMW3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GabreA2AMW3 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GabreA2AMW3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GabreA2AMW3 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GabreA2AMW3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GabreA2AMW3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GabreA2AMW3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GabreA2AMW3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GabreA2AMW3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GabreA2AMW3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GabreA2AMW3 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GabreA2AMW3 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GabreA2AMW3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GabreA2AMW3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GabreA2AMW3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GabreA2AMW3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GabreA2AMW3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms