Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Frmpd1A2AKB4 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Frmpd1A2AKB4 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Frmpd1A2AKB4 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Frmpd1A2AKB4 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Frmpd1A2AKB4 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Frmpd1A2AKB4 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Frmpd1A2AKB4 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Frmpd1A2AKB4 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Frmpd1A2AKB4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Frmpd1A2AKB4 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Frmpd1A2AKB4 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
Frmpd1A2AKB4 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Frmpd1A2AKB4 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
Frmpd1A2AKB4 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Frmpd1A2AKB4 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC31.4■■■□□ 2.62
Frmpd1A2AKB4 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC31.4■■■□□ 2.62
Frmpd1A2AKB4 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC31.4■■■□□ 2.62
Frmpd1A2AKB4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Frmpd1A2AKB4 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Frmpd1A2AKB4 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Frmpd1A2AKB4 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Frmpd1A2AKB4 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC31.39■■■□□ 2.62
Frmpd1A2AKB4 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
Frmpd1A2AKB4 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Frmpd1A2AKB4 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Frmpd1A2AKB4 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Frmpd1A2AKB4 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC31.39■■■□□ 2.61
Frmpd1A2AKB4 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
Frmpd1A2AKB4 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Frmpd1A2AKB4 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
Frmpd1A2AKB4 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
Frmpd1A2AKB4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Frmpd1A2AKB4 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
Frmpd1A2AKB4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
Frmpd1A2AKB4 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Frmpd1A2AKB4 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
Frmpd1A2AKB4 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
Frmpd1A2AKB4 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC31.36■■■□□ 2.61
Frmpd1A2AKB4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Frmpd1A2AKB4 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Frmpd1A2AKB4 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Frmpd1A2AKB4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Frmpd1A2AKB4 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Frmpd1A2AKB4 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Frmpd1A2AKB4 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Frmpd1A2AKB4 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Frmpd1A2AKB4 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Frmpd1A2AKB4 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Frmpd1A2AKB4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
Frmpd1A2AKB4 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Frmpd1A2AKB4 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
Frmpd1A2AKB4 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
Frmpd1A2AKB4 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Frmpd1A2AKB4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Frmpd1A2AKB4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Frmpd1A2AKB4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Frmpd1A2AKB4 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Frmpd1A2AKB4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Frmpd1A2AKB4 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Frmpd1A2AKB4 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Frmpd1A2AKB4 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Frmpd1A2AKB4 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
Frmpd1A2AKB4 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Frmpd1A2AKB4 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
Frmpd1A2AKB4 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Frmpd1A2AKB4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Frmpd1A2AKB4 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Frmpd1A2AKB4 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Frmpd1A2AKB4 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Frmpd1A2AKB4 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Frmpd1A2AKB4 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Frmpd1A2AKB4 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Frmpd1A2AKB4 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Frmpd1A2AKB4 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Frmpd1A2AKB4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Frmpd1A2AKB4 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
Frmpd1A2AKB4 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Frmpd1A2AKB4 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
Frmpd1A2AKB4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Frmpd1A2AKB4 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Frmpd1A2AKB4 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Frmpd1A2AKB4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Frmpd1A2AKB4 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Frmpd1A2AKB4 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Frmpd1A2AKB4 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Frmpd1A2AKB4 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
Frmpd1A2AKB4 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Frmpd1A2AKB4 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
Frmpd1A2AKB4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Frmpd1A2AKB4 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Frmpd1A2AKB4 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Frmpd1A2AKB4 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Frmpd1A2AKB4 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Frmpd1A2AKB4 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
Frmpd1A2AKB4 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Frmpd1A2AKB4 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
Frmpd1A2AKB4 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Frmpd1A2AKB4 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Frmpd1A2AKB4 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms