Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB1

Ccdc183, Coiled-coil domain-containing protein 183, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc183A2AJB1 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc183A2AJB1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc183A2AJB1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc183A2AJB1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc183A2AJB1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc183A2AJB1 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc183A2AJB1 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc183A2AJB1 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc183A2AJB1 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc183A2AJB1 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc183A2AJB1 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc183A2AJB1 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc183A2AJB1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc183A2AJB1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc183A2AJB1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc183A2AJB1 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc183A2AJB1 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc183A2AJB1 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc183A2AJB1 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc183A2AJB1 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc183A2AJB1 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc183A2AJB1 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc183A2AJB1 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc183A2AJB1 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc183A2AJB1 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc183A2AJB1 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc183A2AJB1 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc183A2AJB1 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc183A2AJB1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc183A2AJB1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc183A2AJB1 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc183A2AJB1 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc183A2AJB1 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc183A2AJB1 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc183A2AJB1 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc183A2AJB1 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc183A2AJB1 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc183A2AJB1 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc183A2AJB1 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc183A2AJB1 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc183A2AJB1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc183A2AJB1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc183A2AJB1 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc183A2AJB1 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc183A2AJB1 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc183A2AJB1 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc183A2AJB1 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc183A2AJB1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc183A2AJB1 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc183A2AJB1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc183A2AJB1 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc183A2AJB1 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc183A2AJB1 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc183A2AJB1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc183A2AJB1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc183A2AJB1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc183A2AJB1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc183A2AJB1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc183A2AJB1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc183A2AJB1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc183A2AJB1 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc183A2AJB1 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc183A2AJB1 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc183A2AJB1 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc183A2AJB1 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc183A2AJB1 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc183A2AJB1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc183A2AJB1 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc183A2AJB1 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc183A2AJB1 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc183A2AJB1 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc183A2AJB1 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc183A2AJB1 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc183A2AJB1 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc183A2AJB1 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc183A2AJB1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc183A2AJB1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc183A2AJB1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc183A2AJB1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc183A2AJB1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc183A2AJB1 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc183A2AJB1 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc183A2AJB1 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc183A2AJB1 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc183A2AJB1 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc183A2AJB1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc183A2AJB1 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc183A2AJB1 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc183A2AJB1 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc183A2AJB1 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc183A2AJB1 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc183A2AJB1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc183A2AJB1 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc183A2AJB1 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc183A2AJB1 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc183A2AJB1 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc183A2AJB1 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc183A2AJB1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc183A2AJB1 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc183A2AJB1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms