Protein–RNA interactions for Protein: A2AIV2

Virma, Protein virilizer homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VirmaA2AIV2 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VirmaA2AIV2 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VirmaA2AIV2 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VirmaA2AIV2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VirmaA2AIV2 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VirmaA2AIV2 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VirmaA2AIV2 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
VirmaA2AIV2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VirmaA2AIV2 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VirmaA2AIV2 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VirmaA2AIV2 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
VirmaA2AIV2 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VirmaA2AIV2 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VirmaA2AIV2 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VirmaA2AIV2 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VirmaA2AIV2 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VirmaA2AIV2 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VirmaA2AIV2 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VirmaA2AIV2 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VirmaA2AIV2 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VirmaA2AIV2 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
VirmaA2AIV2 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
VirmaA2AIV2 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VirmaA2AIV2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VirmaA2AIV2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VirmaA2AIV2 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VirmaA2AIV2 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VirmaA2AIV2 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VirmaA2AIV2 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VirmaA2AIV2 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
VirmaA2AIV2 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VirmaA2AIV2 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VirmaA2AIV2 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VirmaA2AIV2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VirmaA2AIV2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VirmaA2AIV2 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VirmaA2AIV2 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
VirmaA2AIV2 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
VirmaA2AIV2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
VirmaA2AIV2 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VirmaA2AIV2 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VirmaA2AIV2 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VirmaA2AIV2 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VirmaA2AIV2 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VirmaA2AIV2 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VirmaA2AIV2 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VirmaA2AIV2 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VirmaA2AIV2 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VirmaA2AIV2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VirmaA2AIV2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VirmaA2AIV2 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VirmaA2AIV2 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VirmaA2AIV2 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VirmaA2AIV2 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VirmaA2AIV2 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VirmaA2AIV2 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VirmaA2AIV2 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VirmaA2AIV2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VirmaA2AIV2 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VirmaA2AIV2 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VirmaA2AIV2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VirmaA2AIV2 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
VirmaA2AIV2 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
VirmaA2AIV2 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
VirmaA2AIV2 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VirmaA2AIV2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VirmaA2AIV2 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VirmaA2AIV2 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VirmaA2AIV2 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VirmaA2AIV2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VirmaA2AIV2 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VirmaA2AIV2 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VirmaA2AIV2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VirmaA2AIV2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VirmaA2AIV2 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VirmaA2AIV2 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VirmaA2AIV2 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VirmaA2AIV2 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
VirmaA2AIV2 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
VirmaA2AIV2 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
VirmaA2AIV2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VirmaA2AIV2 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VirmaA2AIV2 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VirmaA2AIV2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
VirmaA2AIV2 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VirmaA2AIV2 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VirmaA2AIV2 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
VirmaA2AIV2 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
VirmaA2AIV2 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VirmaA2AIV2 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VirmaA2AIV2 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
VirmaA2AIV2 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VirmaA2AIV2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VirmaA2AIV2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VirmaA2AIV2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VirmaA2AIV2 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VirmaA2AIV2 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VirmaA2AIV2 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VirmaA2AIV2 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VirmaA2AIV2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms