Protein–RNA interactions for Protein: A2AGA4

Rhbdl2, Rhomboid-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl2A2AGA4 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rhbdl2A2AGA4 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Rhbdl2A2AGA4 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rhbdl2A2AGA4 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rhbdl2A2AGA4 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rhbdl2A2AGA4 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rhbdl2A2AGA4 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rhbdl2A2AGA4 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rhbdl2A2AGA4 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rhbdl2A2AGA4 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rhbdl2A2AGA4 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rhbdl2A2AGA4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rhbdl2A2AGA4 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rhbdl2A2AGA4 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rhbdl2A2AGA4 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rhbdl2A2AGA4 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rhbdl2A2AGA4 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rhbdl2A2AGA4 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rhbdl2A2AGA4 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rhbdl2A2AGA4 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rhbdl2A2AGA4 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rhbdl2A2AGA4 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rhbdl2A2AGA4 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rhbdl2A2AGA4 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rhbdl2A2AGA4 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rhbdl2A2AGA4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rhbdl2A2AGA4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rhbdl2A2AGA4 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rhbdl2A2AGA4 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rhbdl2A2AGA4 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rhbdl2A2AGA4 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rhbdl2A2AGA4 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rhbdl2A2AGA4 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rhbdl2A2AGA4 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rhbdl2A2AGA4 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rhbdl2A2AGA4 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Rhbdl2A2AGA4 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Rhbdl2A2AGA4 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rhbdl2A2AGA4 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rhbdl2A2AGA4 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rhbdl2A2AGA4 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rhbdl2A2AGA4 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rhbdl2A2AGA4 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rhbdl2A2AGA4 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rhbdl2A2AGA4 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rhbdl2A2AGA4 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rhbdl2A2AGA4 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhbdl2A2AGA4 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhbdl2A2AGA4 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhbdl2A2AGA4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhbdl2A2AGA4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhbdl2A2AGA4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhbdl2A2AGA4 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhbdl2A2AGA4 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhbdl2A2AGA4 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhbdl2A2AGA4 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhbdl2A2AGA4 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhbdl2A2AGA4 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhbdl2A2AGA4 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhbdl2A2AGA4 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhbdl2A2AGA4 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhbdl2A2AGA4 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhbdl2A2AGA4 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhbdl2A2AGA4 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rhbdl2A2AGA4 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhbdl2A2AGA4 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhbdl2A2AGA4 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhbdl2A2AGA4 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhbdl2A2AGA4 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhbdl2A2AGA4 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhbdl2A2AGA4 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhbdl2A2AGA4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhbdl2A2AGA4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhbdl2A2AGA4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhbdl2A2AGA4 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhbdl2A2AGA4 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhbdl2A2AGA4 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhbdl2A2AGA4 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhbdl2A2AGA4 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhbdl2A2AGA4 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhbdl2A2AGA4 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rhbdl2A2AGA4 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhbdl2A2AGA4 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhbdl2A2AGA4 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhbdl2A2AGA4 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhbdl2A2AGA4 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhbdl2A2AGA4 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhbdl2A2AGA4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhbdl2A2AGA4 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhbdl2A2AGA4 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhbdl2A2AGA4 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhbdl2A2AGA4 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhbdl2A2AGA4 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhbdl2A2AGA4 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhbdl2A2AGA4 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhbdl2A2AGA4 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rhbdl2A2AGA4 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rhbdl2A2AGA4 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rhbdl2A2AGA4 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rhbdl2A2AGA4 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms