Protein–RNA interactions for Protein: A2ACP1

Ttc39a, Tetratricopeptide repeat protein 39A, mousemouse

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39aA2ACP1 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ttc39aA2ACP1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ttc39aA2ACP1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ttc39aA2ACP1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttc39aA2ACP1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttc39aA2ACP1 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttc39aA2ACP1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttc39aA2ACP1 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttc39aA2ACP1 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttc39aA2ACP1 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttc39aA2ACP1 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttc39aA2ACP1 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttc39aA2ACP1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttc39aA2ACP1 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttc39aA2ACP1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttc39aA2ACP1 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttc39aA2ACP1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttc39aA2ACP1 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttc39aA2ACP1 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttc39aA2ACP1 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttc39aA2ACP1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttc39aA2ACP1 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttc39aA2ACP1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttc39aA2ACP1 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttc39aA2ACP1 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttc39aA2ACP1 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttc39aA2ACP1 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttc39aA2ACP1 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttc39aA2ACP1 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttc39aA2ACP1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttc39aA2ACP1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttc39aA2ACP1 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttc39aA2ACP1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttc39aA2ACP1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttc39aA2ACP1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttc39aA2ACP1 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttc39aA2ACP1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttc39aA2ACP1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttc39aA2ACP1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttc39aA2ACP1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttc39aA2ACP1 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttc39aA2ACP1 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttc39aA2ACP1 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttc39aA2ACP1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttc39aA2ACP1 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttc39aA2ACP1 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttc39aA2ACP1 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttc39aA2ACP1 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttc39aA2ACP1 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttc39aA2ACP1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttc39aA2ACP1 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttc39aA2ACP1 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttc39aA2ACP1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttc39aA2ACP1 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttc39aA2ACP1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttc39aA2ACP1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttc39aA2ACP1 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ttc39aA2ACP1 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ttc39aA2ACP1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ttc39aA2ACP1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ttc39aA2ACP1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ttc39aA2ACP1 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ttc39aA2ACP1 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ttc39aA2ACP1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ttc39aA2ACP1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ttc39aA2ACP1 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ttc39aA2ACP1 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ttc39aA2ACP1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ttc39aA2ACP1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ttc39aA2ACP1 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ttc39aA2ACP1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ttc39aA2ACP1 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ttc39aA2ACP1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ttc39aA2ACP1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttc39aA2ACP1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttc39aA2ACP1 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttc39aA2ACP1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttc39aA2ACP1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttc39aA2ACP1 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttc39aA2ACP1 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttc39aA2ACP1 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttc39aA2ACP1 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttc39aA2ACP1 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttc39aA2ACP1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttc39aA2ACP1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttc39aA2ACP1 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttc39aA2ACP1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttc39aA2ACP1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ttc39aA2ACP1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ttc39aA2ACP1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ttc39aA2ACP1 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ttc39aA2ACP1 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ttc39aA2ACP1 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ttc39aA2ACP1 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ttc39aA2ACP1 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ttc39aA2ACP1 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ttc39aA2ACP1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ttc39aA2ACP1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttc39aA2ACP1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttc39aA2ACP1 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms