Protein–RNA interactions for Protein: A2A863

Itgb4, Integrin beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb4A2A863 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itgb4A2A863 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itgb4A2A863 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itgb4A2A863 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itgb4A2A863 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itgb4A2A863 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itgb4A2A863 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Itgb4A2A863 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Itgb4A2A863 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Itgb4A2A863 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Itgb4A2A863 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Itgb4A2A863 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Itgb4A2A863 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Itgb4A2A863 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Itgb4A2A863 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Itgb4A2A863 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Itgb4A2A863 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Itgb4A2A863 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Itgb4A2A863 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Itgb4A2A863 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Itgb4A2A863 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Itgb4A2A863 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Itgb4A2A863 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Itgb4A2A863 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Itgb4A2A863 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Itgb4A2A863 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Itgb4A2A863 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Itgb4A2A863 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Itgb4A2A863 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Itgb4A2A863 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Itgb4A2A863 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Itgb4A2A863 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Itgb4A2A863 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Itgb4A2A863 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Itgb4A2A863 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Itgb4A2A863 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Itgb4A2A863 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Itgb4A2A863 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Itgb4A2A863 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Itgb4A2A863 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Itgb4A2A863 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Itgb4A2A863 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Itgb4A2A863 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Itgb4A2A863 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Itgb4A2A863 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Itgb4A2A863 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Itgb4A2A863 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Itgb4A2A863 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Itgb4A2A863 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Itgb4A2A863 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Itgb4A2A863 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Itgb4A2A863 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Itgb4A2A863 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Itgb4A2A863 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Itgb4A2A863 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Itgb4A2A863 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Itgb4A2A863 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Itgb4A2A863 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Itgb4A2A863 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Itgb4A2A863 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Itgb4A2A863 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Itgb4A2A863 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Itgb4A2A863 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Itgb4A2A863 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Itgb4A2A863 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Itgb4A2A863 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Itgb4A2A863 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Itgb4A2A863 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Itgb4A2A863 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Itgb4A2A863 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Itgb4A2A863 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Itgb4A2A863 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Itgb4A2A863 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Itgb4A2A863 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Itgb4A2A863 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Itgb4A2A863 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Itgb4A2A863 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Itgb4A2A863 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Itgb4A2A863 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Itgb4A2A863 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Itgb4A2A863 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Itgb4A2A863 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Itgb4A2A863 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Itgb4A2A863 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Itgb4A2A863 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Itgb4A2A863 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Itgb4A2A863 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Itgb4A2A863 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Itgb4A2A863 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Itgb4A2A863 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Itgb4A2A863 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Itgb4A2A863 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Itgb4A2A863 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Itgb4A2A863 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Itgb4A2A863 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Itgb4A2A863 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Itgb4A2A863 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Itgb4A2A863 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Itgb4A2A863 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Itgb4A2A863 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms