Protein–RNA interactions for Protein: A2A6A1

Gpatch8, G patch domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpatch8A2A6A1 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Gpatch8A2A6A1 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Gpatch8A2A6A1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Gpatch8A2A6A1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Gpatch8A2A6A1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Gpatch8A2A6A1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Gpatch8A2A6A1 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Gpatch8A2A6A1 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Gpatch8A2A6A1 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Gpatch8A2A6A1 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Gpatch8A2A6A1 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Gpatch8A2A6A1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Gpatch8A2A6A1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Gpatch8A2A6A1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Gpatch8A2A6A1 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Gpatch8A2A6A1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Gpatch8A2A6A1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Gpatch8A2A6A1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Gpatch8A2A6A1 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Gpatch8A2A6A1 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Gpatch8A2A6A1 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Gpatch8A2A6A1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Gpatch8A2A6A1 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Gpatch8A2A6A1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Gpatch8A2A6A1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Gpatch8A2A6A1 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Gpatch8A2A6A1 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Gpatch8A2A6A1 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Gpatch8A2A6A1 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Gpatch8A2A6A1 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Gpatch8A2A6A1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Gpatch8A2A6A1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Gpatch8A2A6A1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Gpatch8A2A6A1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Gpatch8A2A6A1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Gpatch8A2A6A1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Gpatch8A2A6A1 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Gpatch8A2A6A1 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Gpatch8A2A6A1 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Gpatch8A2A6A1 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Gpatch8A2A6A1 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Gpatch8A2A6A1 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Gpatch8A2A6A1 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Gpatch8A2A6A1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Gpatch8A2A6A1 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Gpatch8A2A6A1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Gpatch8A2A6A1 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Gpatch8A2A6A1 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Gpatch8A2A6A1 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Gpatch8A2A6A1 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Gpatch8A2A6A1 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Gpatch8A2A6A1 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Gpatch8A2A6A1 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Gpatch8A2A6A1 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Gpatch8A2A6A1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Gpatch8A2A6A1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Gpatch8A2A6A1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Gpatch8A2A6A1 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Gpatch8A2A6A1 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Gpatch8A2A6A1 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Gpatch8A2A6A1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Gpatch8A2A6A1 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Gpatch8A2A6A1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Gpatch8A2A6A1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Gpatch8A2A6A1 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Gpatch8A2A6A1 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Gpatch8A2A6A1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Gpatch8A2A6A1 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Gpatch8A2A6A1 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Gpatch8A2A6A1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Gpatch8A2A6A1 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Gpatch8A2A6A1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Gpatch8A2A6A1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Gpatch8A2A6A1 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Gpatch8A2A6A1 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Gpatch8A2A6A1 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Gpatch8A2A6A1 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Gpatch8A2A6A1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Gpatch8A2A6A1 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Gpatch8A2A6A1 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Gpatch8A2A6A1 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Gpatch8A2A6A1 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Gpatch8A2A6A1 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Gpatch8A2A6A1 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Gpatch8A2A6A1 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Gpatch8A2A6A1 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Gpatch8A2A6A1 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Gpatch8A2A6A1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Gpatch8A2A6A1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Gpatch8A2A6A1 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Gpatch8A2A6A1 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Gpatch8A2A6A1 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Gpatch8A2A6A1 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Gpatch8A2A6A1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Gpatch8A2A6A1 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Gpatch8A2A6A1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Gpatch8A2A6A1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Gpatch8A2A6A1 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Gpatch8A2A6A1 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Gpatch8A2A6A1 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms