Protein–RNA interactions for Protein: A0N8N6

Trav12-2, T cell receptor alpha variable 12-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav12-2A0N8N6 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trav12-2A0N8N6 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trav12-2A0N8N6 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trav12-2A0N8N6 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trav12-2A0N8N6 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trav12-2A0N8N6 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trav12-2A0N8N6 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trav12-2A0N8N6 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trav12-2A0N8N6 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trav12-2A0N8N6 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trav12-2A0N8N6 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trav12-2A0N8N6 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trav12-2A0N8N6 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trav12-2A0N8N6 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trav12-2A0N8N6 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trav12-2A0N8N6 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trav12-2A0N8N6 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trav12-2A0N8N6 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trav12-2A0N8N6 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trav12-2A0N8N6 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trav12-2A0N8N6 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trav12-2A0N8N6 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trav12-2A0N8N6 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trav12-2A0N8N6 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trav12-2A0N8N6 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trav12-2A0N8N6 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trav12-2A0N8N6 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trav12-2A0N8N6 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trav12-2A0N8N6 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trav12-2A0N8N6 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trav12-2A0N8N6 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trav12-2A0N8N6 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trav12-2A0N8N6 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trav12-2A0N8N6 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trav12-2A0N8N6 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trav12-2A0N8N6 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trav12-2A0N8N6 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trav12-2A0N8N6 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trav12-2A0N8N6 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trav12-2A0N8N6 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trav12-2A0N8N6 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trav12-2A0N8N6 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trav12-2A0N8N6 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trav12-2A0N8N6 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trav12-2A0N8N6 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trav12-2A0N8N6 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trav12-2A0N8N6 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trav12-2A0N8N6 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trav12-2A0N8N6 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trav12-2A0N8N6 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trav12-2A0N8N6 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trav12-2A0N8N6 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trav12-2A0N8N6 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trav12-2A0N8N6 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trav12-2A0N8N6 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trav12-2A0N8N6 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trav12-2A0N8N6 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trav12-2A0N8N6 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trav12-2A0N8N6 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trav12-2A0N8N6 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trav12-2A0N8N6 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trav12-2A0N8N6 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trav12-2A0N8N6 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trav12-2A0N8N6 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trav12-2A0N8N6 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trav12-2A0N8N6 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trav12-2A0N8N6 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trav12-2A0N8N6 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trav12-2A0N8N6 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trav12-2A0N8N6 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trav12-2A0N8N6 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trav12-2A0N8N6 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trav12-2A0N8N6 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trav12-2A0N8N6 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trav12-2A0N8N6 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trav12-2A0N8N6 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trav12-2A0N8N6 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trav12-2A0N8N6 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trav12-2A0N8N6 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trav12-2A0N8N6 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trav12-2A0N8N6 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trav12-2A0N8N6 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trav12-2A0N8N6 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trav12-2A0N8N6 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trav12-2A0N8N6 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trav12-2A0N8N6 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trav12-2A0N8N6 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trav12-2A0N8N6 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trav12-2A0N8N6 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trav12-2A0N8N6 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trav12-2A0N8N6 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trav12-2A0N8N6 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trav12-2A0N8N6 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trav12-2A0N8N6 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trav12-2A0N8N6 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trav12-2A0N8N6 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trav12-2A0N8N6 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trav12-2A0N8N6 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trav12-2A0N8N6 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trav12-2A0N8N6 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms