Protein–RNA interactions for Protein: A0JLY1

Ccdc173, Coiled-coil domain-containing protein 173, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc173A0JLY1 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc173A0JLY1 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc173A0JLY1 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc173A0JLY1 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc173A0JLY1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc173A0JLY1 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc173A0JLY1 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc173A0JLY1 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc173A0JLY1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc173A0JLY1 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc173A0JLY1 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc173A0JLY1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc173A0JLY1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc173A0JLY1 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc173A0JLY1 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc173A0JLY1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc173A0JLY1 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc173A0JLY1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc173A0JLY1 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc173A0JLY1 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc173A0JLY1 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc173A0JLY1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc173A0JLY1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc173A0JLY1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc173A0JLY1 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc173A0JLY1 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc173A0JLY1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc173A0JLY1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc173A0JLY1 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc173A0JLY1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc173A0JLY1 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc173A0JLY1 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc173A0JLY1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc173A0JLY1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc173A0JLY1 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc173A0JLY1 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc173A0JLY1 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc173A0JLY1 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc173A0JLY1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc173A0JLY1 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc173A0JLY1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc173A0JLY1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc173A0JLY1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc173A0JLY1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc173A0JLY1 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc173A0JLY1 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc173A0JLY1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc173A0JLY1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc173A0JLY1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc173A0JLY1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc173A0JLY1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc173A0JLY1 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc173A0JLY1 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc173A0JLY1 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc173A0JLY1 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc173A0JLY1 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc173A0JLY1 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc173A0JLY1 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc173A0JLY1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc173A0JLY1 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc173A0JLY1 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc173A0JLY1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc173A0JLY1 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc173A0JLY1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc173A0JLY1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc173A0JLY1 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc173A0JLY1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc173A0JLY1 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc173A0JLY1 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc173A0JLY1 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc173A0JLY1 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc173A0JLY1 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc173A0JLY1 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc173A0JLY1 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc173A0JLY1 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc173A0JLY1 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc173A0JLY1 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc173A0JLY1 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc173A0JLY1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc173A0JLY1 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc173A0JLY1 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc173A0JLY1 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc173A0JLY1 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc173A0JLY1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc173A0JLY1 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc173A0JLY1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc173A0JLY1 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc173A0JLY1 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc173A0JLY1 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc173A0JLY1 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc173A0JLY1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc173A0JLY1 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc173A0JLY1 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc173A0JLY1 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc173A0JLY1 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc173A0JLY1 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc173A0JLY1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc173A0JLY1 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc173A0JLY1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc173A0JLY1 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms