Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GSI2

1700018G05Rik, RIKEN cDNA 1700018G05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
1700018G05RikA0A1B0GSI2 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
1700018G05RikA0A1B0GSI2 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
1700018G05RikA0A1B0GSI2 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
1700018G05RikA0A1B0GSI2 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
1700018G05RikA0A1B0GSI2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
1700018G05RikA0A1B0GSI2 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
1700018G05RikA0A1B0GSI2 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms