Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LIF8

Irgm2, Immunity-related GTPase family M member 2, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irgm2A0A140LIF8 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Irgm2A0A140LIF8 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Irgm2A0A140LIF8 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Irgm2A0A140LIF8 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Irgm2A0A140LIF8 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Irgm2A0A140LIF8 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Irgm2A0A140LIF8 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Irgm2A0A140LIF8 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Irgm2A0A140LIF8 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Irgm2A0A140LIF8 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Irgm2A0A140LIF8 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Irgm2A0A140LIF8 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Irgm2A0A140LIF8 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Irgm2A0A140LIF8 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Irgm2A0A140LIF8 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Irgm2A0A140LIF8 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Irgm2A0A140LIF8 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Irgm2A0A140LIF8 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Irgm2A0A140LIF8 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Irgm2A0A140LIF8 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Irgm2A0A140LIF8 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Irgm2A0A140LIF8 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Irgm2A0A140LIF8 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Irgm2A0A140LIF8 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Irgm2A0A140LIF8 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Irgm2A0A140LIF8 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Irgm2A0A140LIF8 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Irgm2A0A140LIF8 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Irgm2A0A140LIF8 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Irgm2A0A140LIF8 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Irgm2A0A140LIF8 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Irgm2A0A140LIF8 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Irgm2A0A140LIF8 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Irgm2A0A140LIF8 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Irgm2A0A140LIF8 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Irgm2A0A140LIF8 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Irgm2A0A140LIF8 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Irgm2A0A140LIF8 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Irgm2A0A140LIF8 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Irgm2A0A140LIF8 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Irgm2A0A140LIF8 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Irgm2A0A140LIF8 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Irgm2A0A140LIF8 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Irgm2A0A140LIF8 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Irgm2A0A140LIF8 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Irgm2A0A140LIF8 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Irgm2A0A140LIF8 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Irgm2A0A140LIF8 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Irgm2A0A140LIF8 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Irgm2A0A140LIF8 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Irgm2A0A140LIF8 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Irgm2A0A140LIF8 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Irgm2A0A140LIF8 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Irgm2A0A140LIF8 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Irgm2A0A140LIF8 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Irgm2A0A140LIF8 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Irgm2A0A140LIF8 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Irgm2A0A140LIF8 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Irgm2A0A140LIF8 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Irgm2A0A140LIF8 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Irgm2A0A140LIF8 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Irgm2A0A140LIF8 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Irgm2A0A140LIF8 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Irgm2A0A140LIF8 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Irgm2A0A140LIF8 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Irgm2A0A140LIF8 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Irgm2A0A140LIF8 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Irgm2A0A140LIF8 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Irgm2A0A140LIF8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Irgm2A0A140LIF8 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Irgm2A0A140LIF8 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Irgm2A0A140LIF8 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Irgm2A0A140LIF8 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Irgm2A0A140LIF8 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Irgm2A0A140LIF8 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Irgm2A0A140LIF8 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Irgm2A0A140LIF8 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Irgm2A0A140LIF8 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Irgm2A0A140LIF8 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Irgm2A0A140LIF8 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Irgm2A0A140LIF8 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Irgm2A0A140LIF8 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Irgm2A0A140LIF8 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Irgm2A0A140LIF8 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Irgm2A0A140LIF8 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Irgm2A0A140LIF8 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Irgm2A0A140LIF8 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Irgm2A0A140LIF8 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Irgm2A0A140LIF8 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Irgm2A0A140LIF8 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Irgm2A0A140LIF8 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Irgm2A0A140LIF8 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Irgm2A0A140LIF8 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Irgm2A0A140LIF8 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Irgm2A0A140LIF8 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Irgm2A0A140LIF8 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Irgm2A0A140LIF8 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Irgm2A0A140LIF8 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Irgm2A0A140LIF8 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Irgm2A0A140LIF8 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms