Protein–RNA interactions for Protein: A0A0R4J054

4921501E09Rik, RIKEN cDNA 4921501E09, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921501E09RikA0A0R4J054 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
4921501E09RikA0A0R4J054 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
4921501E09RikA0A0R4J054 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
4921501E09RikA0A0R4J054 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
4921501E09RikA0A0R4J054 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
4921501E09RikA0A0R4J054 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
4921501E09RikA0A0R4J054 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
4921501E09RikA0A0R4J054 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
4921501E09RikA0A0R4J054 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
4921501E09RikA0A0R4J054 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
4921501E09RikA0A0R4J054 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
4921501E09RikA0A0R4J054 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
4921501E09RikA0A0R4J054 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
4921501E09RikA0A0R4J054 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
4921501E09RikA0A0R4J054 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
4921501E09RikA0A0R4J054 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
4921501E09RikA0A0R4J054 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
4921501E09RikA0A0R4J054 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
4921501E09RikA0A0R4J054 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
4921501E09RikA0A0R4J054 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
4921501E09RikA0A0R4J054 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
4921501E09RikA0A0R4J054 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
4921501E09RikA0A0R4J054 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
4921501E09RikA0A0R4J054 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
4921501E09RikA0A0R4J054 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
4921501E09RikA0A0R4J054 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
4921501E09RikA0A0R4J054 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
4921501E09RikA0A0R4J054 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4921501E09RikA0A0R4J054 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4921501E09RikA0A0R4J054 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
4921501E09RikA0A0R4J054 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
4921501E09RikA0A0R4J054 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4921501E09RikA0A0R4J054 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4921501E09RikA0A0R4J054 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
4921501E09RikA0A0R4J054 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
4921501E09RikA0A0R4J054 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4921501E09RikA0A0R4J054 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
4921501E09RikA0A0R4J054 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4921501E09RikA0A0R4J054 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
4921501E09RikA0A0R4J054 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4921501E09RikA0A0R4J054 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
4921501E09RikA0A0R4J054 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
4921501E09RikA0A0R4J054 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4921501E09RikA0A0R4J054 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4921501E09RikA0A0R4J054 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4921501E09RikA0A0R4J054 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4921501E09RikA0A0R4J054 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4921501E09RikA0A0R4J054 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
4921501E09RikA0A0R4J054 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
4921501E09RikA0A0R4J054 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
4921501E09RikA0A0R4J054 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
4921501E09RikA0A0R4J054 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
4921501E09RikA0A0R4J054 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
4921501E09RikA0A0R4J054 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
4921501E09RikA0A0R4J054 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
4921501E09RikA0A0R4J054 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
4921501E09RikA0A0R4J054 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
4921501E09RikA0A0R4J054 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
4921501E09RikA0A0R4J054 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
4921501E09RikA0A0R4J054 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
4921501E09RikA0A0R4J054 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
4921501E09RikA0A0R4J054 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
4921501E09RikA0A0R4J054 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4921501E09RikA0A0R4J054 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
4921501E09RikA0A0R4J054 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
4921501E09RikA0A0R4J054 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4921501E09RikA0A0R4J054 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
4921501E09RikA0A0R4J054 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4921501E09RikA0A0R4J054 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4921501E09RikA0A0R4J054 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
4921501E09RikA0A0R4J054 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4921501E09RikA0A0R4J054 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4921501E09RikA0A0R4J054 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4921501E09RikA0A0R4J054 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4921501E09RikA0A0R4J054 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
4921501E09RikA0A0R4J054 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4921501E09RikA0A0R4J054 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4921501E09RikA0A0R4J054 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
4921501E09RikA0A0R4J054 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4921501E09RikA0A0R4J054 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4921501E09RikA0A0R4J054 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4921501E09RikA0A0R4J054 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4921501E09RikA0A0R4J054 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4921501E09RikA0A0R4J054 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
4921501E09RikA0A0R4J054 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
4921501E09RikA0A0R4J054 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
4921501E09RikA0A0R4J054 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
4921501E09RikA0A0R4J054 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms