Protein–RNA interactions for Protein: A0A0G2JFS9

Atg4a-ps, Cysteine protease, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atg4a-psA0A0G2JFS9 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atg4a-psA0A0G2JFS9 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atg4a-psA0A0G2JFS9 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atg4a-psA0A0G2JFS9 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atg4a-psA0A0G2JFS9 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atg4a-psA0A0G2JFS9 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atg4a-psA0A0G2JFS9 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atg4a-psA0A0G2JFS9 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Atg4a-psA0A0G2JFS9 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atg4a-psA0A0G2JFS9 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms