Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YW32

Ighv1-37, Immunoglobulin heavy variable 1-37 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv1-37A0A0A6YW32 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ighv1-37A0A0A6YW32 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ighv1-37A0A0A6YW32 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ighv1-37A0A0A6YW32 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ighv1-37A0A0A6YW32 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ighv1-37A0A0A6YW32 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ighv1-37A0A0A6YW32 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ighv1-37A0A0A6YW32 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ighv1-37A0A0A6YW32 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ighv1-37A0A0A6YW32 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ighv1-37A0A0A6YW32 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ighv1-37A0A0A6YW32 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ighv1-37A0A0A6YW32 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ighv1-37A0A0A6YW32 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ighv1-37A0A0A6YW32 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ighv1-37A0A0A6YW32 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ighv1-37A0A0A6YW32 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ighv1-37A0A0A6YW32 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ighv1-37A0A0A6YW32 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ighv1-37A0A0A6YW32 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ighv1-37A0A0A6YW32 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ighv1-37A0A0A6YW32 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ighv1-37A0A0A6YW32 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ighv1-37A0A0A6YW32 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ighv1-37A0A0A6YW32 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ighv1-37A0A0A6YW32 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ighv1-37A0A0A6YW32 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ighv1-37A0A0A6YW32 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ighv1-37A0A0A6YW32 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ighv1-37A0A0A6YW32 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ighv1-37A0A0A6YW32 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ighv1-37A0A0A6YW32 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ighv1-37A0A0A6YW32 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ighv1-37A0A0A6YW32 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ighv1-37A0A0A6YW32 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ighv1-37A0A0A6YW32 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ighv1-37A0A0A6YW32 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ighv1-37A0A0A6YW32 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ighv1-37A0A0A6YW32 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ighv1-37A0A0A6YW32 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ighv1-37A0A0A6YW32 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ighv1-37A0A0A6YW32 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ighv1-37A0A0A6YW32 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ighv1-37A0A0A6YW32 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ighv1-37A0A0A6YW32 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ighv1-37A0A0A6YW32 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ighv1-37A0A0A6YW32 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ighv1-37A0A0A6YW32 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ighv1-37A0A0A6YW32 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ighv1-37A0A0A6YW32 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ighv1-37A0A0A6YW32 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ighv1-37A0A0A6YW32 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ighv1-37A0A0A6YW32 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ighv1-37A0A0A6YW32 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ighv1-37A0A0A6YW32 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ighv1-37A0A0A6YW32 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ighv1-37A0A0A6YW32 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ighv1-37A0A0A6YW32 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ighv1-37A0A0A6YW32 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ighv1-37A0A0A6YW32 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ighv1-37A0A0A6YW32 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ighv1-37A0A0A6YW32 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ighv1-37A0A0A6YW32 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ighv1-37A0A0A6YW32 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ighv1-37A0A0A6YW32 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ighv1-37A0A0A6YW32 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ighv1-37A0A0A6YW32 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ighv1-37A0A0A6YW32 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ighv1-37A0A0A6YW32 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ighv1-37A0A0A6YW32 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ighv1-37A0A0A6YW32 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ighv1-37A0A0A6YW32 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ighv1-37A0A0A6YW32 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ighv1-37A0A0A6YW32 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ighv1-37A0A0A6YW32 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ighv1-37A0A0A6YW32 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ighv1-37A0A0A6YW32 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ighv1-37A0A0A6YW32 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ighv1-37A0A0A6YW32 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ighv1-37A0A0A6YW32 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ighv1-37A0A0A6YW32 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ighv1-37A0A0A6YW32 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ighv1-37A0A0A6YW32 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ighv1-37A0A0A6YW32 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ighv1-37A0A0A6YW32 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ighv1-37A0A0A6YW32 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ighv1-37A0A0A6YW32 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ighv1-37A0A0A6YW32 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ighv1-37A0A0A6YW32 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ighv1-37A0A0A6YW32 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ighv1-37A0A0A6YW32 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ighv1-37A0A0A6YW32 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ighv1-37A0A0A6YW32 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ighv1-37A0A0A6YW32 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ighv1-37A0A0A6YW32 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ighv1-37A0A0A6YW32 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ighv1-37A0A0A6YW32 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ighv1-37A0A0A6YW32 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ighv1-37A0A0A6YW32 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ighv1-37A0A0A6YW32 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms