Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Gm3460-202ENSMUST00000178927 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Gm21103-203ENSMUST00000179042 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Gm8159-203ENSMUST00000179231 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Gm3029-202ENSMUST00000179327 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Gm29016-201ENSMUST00000187523 1013 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Gm37294-201ENSMUST00000193461 494 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Gm43664-201ENSMUST00000196038 734 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Gm2860-201ENSMUST00000199226 707 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Gm45509-201ENSMUST00000209624 1229 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 AC151984.1-201ENSMUST00000218261 2976 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Erh-204ENSMUST00000218364 665 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 AC124489.1-201ENSMUST00000225852 526 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Tti1-201ENSMUST00000029179 3830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Eps15-201ENSMUST00000030281 2980 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 1700011L22Rik-201ENSMUST00000034109 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Olfr1448-201ENSMUST00000054737 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Bglap3-201ENSMUST00000075523 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Gm24451-201ENSMUST00000083353 133 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Vmn1r204-201ENSMUST00000091728 909 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Gm7731-201ENSMUST00000091759 470 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Olfr1306-201ENSMUST00000099607 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Pik3c2g-215ENSMUST00000218528 2712 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Alpk1-206ENSMUST00000198955 4498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Kdm5d-207ENSMUST00000189069 2177 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Dcdc5-201ENSMUST00000037284 3093 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Olfr930-202ENSMUST00000217208 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Gm33148-201ENSMUST00000210835 7227 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Gm28231-201ENSMUST00000190118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Pln-201ENSMUST00000046221 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Slu7-206ENSMUST00000178622 3566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Gm42885-201ENSMUST00000200763 4214 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Gm37310-201ENSMUST00000195237 2968 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Mrpl48-208ENSMUST00000150042 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Olfr802-203ENSMUST00000217576 5297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Gm35850-201ENSMUST00000210956 4653 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Zcchc18-201ENSMUST00000033804 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Gm38200-201ENSMUST00000192083 2111 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Pard3-203ENSMUST00000108752 3497 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Mroh4-201ENSMUST00000023271 3583 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Rdh11-203ENSMUST00000161204 3262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Wdr7-201ENSMUST00000072726 7109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Olfr1340-202ENSMUST00000213436 1948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Kmo-202ENSMUST00000097458 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Pcdhb13-201ENSMUST00000056915 3710 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 AC163354.1-201ENSMUST00000220620 1630 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
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Rnf6Q9DBU5 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Vgll1-202ENSMUST00000114745 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
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Rnf6Q9DBU5 Gm11653-201ENSMUST00000119992 1009 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
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Rnf6Q9DBU5 AV064505-201ENSMUST00000124572 522 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
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Rnf6Q9DBU5 Gm15734-201ENSMUST00000163076 1040 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Svs6-201ENSMUST00000017144 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
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Rnf6Q9DBU5 1700003I22Rik-201ENSMUST00000186048 424 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Platr10-201ENSMUST00000190602 1026 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
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Rnf6Q9DBU5 Gm6166-201ENSMUST00000098689 409 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Cyp4a10-202ENSMUST00000094886 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
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Rnf6Q9DBU5 Gm17203-201ENSMUST00000164379 4017 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Filip1l-203ENSMUST00000159816 4452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Gm42636-201ENSMUST00000197174 2239 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Prame-202ENSMUST00000113159 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Olfr115-202ENSMUST00000221552 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Gm44626-201ENSMUST00000207035 2715 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Cped1-202ENSMUST00000115383 5690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
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Rnf6Q9DBU5 Gm37077-201ENSMUST00000195723 3691 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 AC162301.1-201ENSMUST00000228785 1542 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Bdnf-211ENSMUST00000176893 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Mbd4-202ENSMUST00000122816 2415 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Stat4-201ENSMUST00000027277 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Vmn1r90-201ENSMUST00000185220 7144 ntAPPRIS P2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Aox1-201ENSMUST00000001027 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Map7d2-201ENSMUST00000043151 3087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Synb-201ENSMUST00000059362 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Rab1a-206ENSMUST00000163483 2657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 AC210924.1-201ENSMUST00000221183 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 AC153132.1-201ENSMUST00000222625 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Gm24473-201ENSMUST00000104483 131 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 H2al2a-201ENSMUST00000105001 542 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Gm14466-201ENSMUST00000119028 451 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
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