Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Htt-201ENSMUST00000080036 13215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
NubplQ9CWD8 Zmynd8-202ENSMUST00000088113 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
NubplQ9CWD8 Olfr859-202ENSMUST00000212540 9532 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
NubplQ9CWD8 Cntn4-206ENSMUST00000113264 5262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
NubplQ9CWD8 Mug4-ps-201ENSMUST00000203118 3578 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
NubplQ9CWD8 Kel-201ENSMUST00000031899 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
NubplQ9CWD8 Gm10475-201ENSMUST00000084713 1796 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
NubplQ9CWD8 Dock2-201ENSMUST00000093193 6409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
NubplQ9CWD8 Cast-202ENSMUST00000220738 1653 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
NubplQ9CWD8 Gm43953-201ENSMUST00000203709 2867 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
NubplQ9CWD8 Gm43872-201ENSMUST00000203218 2213 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
NubplQ9CWD8 Gm36041-201ENSMUST00000218971 2245 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
NubplQ9CWD8 Zfp874a-201ENSMUST00000057241 2210 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
NubplQ9CWD8 A930038B10Rik-201ENSMUST00000180412 4084 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
NubplQ9CWD8 Olfr1426-201ENSMUST00000112952 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
NubplQ9CWD8 Vps13a-201ENSMUST00000068156 10838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
NubplQ9CWD8 AC154747.4-203ENSMUST00000225893 1384 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
NubplQ9CWD8 Vmn1r90-203ENSMUST00000226510 6674 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
NubplQ9CWD8 Parn-201ENSMUST00000058884 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
NubplQ9CWD8 Gm42568-201ENSMUST00000195639 1841 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
NubplQ9CWD8 Gm26416-201ENSMUST00000104280 134 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
NubplQ9CWD8 Tm6sf1-202ENSMUST00000119543 1066 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
NubplQ9CWD8 Gm15932-201ENSMUST00000135068 535 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
NubplQ9CWD8 Gm11657-201ENSMUST00000137175 337 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
NubplQ9CWD8 Gm12863-201ENSMUST00000155069 536 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
NubplQ9CWD8 Gm26183-201ENSMUST00000157685 139 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
NubplQ9CWD8 Gm17022-201ENSMUST00000166415 922 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
NubplQ9CWD8 Gm38102-202ENSMUST00000196428 174 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
NubplQ9CWD8 Gpn1-206ENSMUST00000202394 631 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
NubplQ9CWD8 Gm34225-203ENSMUST00000206921 572 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
NubplQ9CWD8 4933402C06Rik-203ENSMUST00000207559 1227 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
NubplQ9CWD8 Gm35021-202ENSMUST00000210289 961 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
NubplQ9CWD8 Olfr1010-201ENSMUST00000216831 1270 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
NubplQ9CWD8 Gm31763-203ENSMUST00000219739 1025 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
NubplQ9CWD8 AC153793.1-201ENSMUST00000220956 1298 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
NubplQ9CWD8 Gm46379-201ENSMUST00000222551 265 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
NubplQ9CWD8 Gm34639-202ENSMUST00000223473 649 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
NubplQ9CWD8 AC154380.1-201ENSMUST00000226804 720 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
NubplQ9CWD8 AC156574.1-201ENSMUST00000227084 452 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
NubplQ9CWD8 AC121542.2-201ENSMUST00000227529 400 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
NubplQ9CWD8 Hamp2-201ENSMUST00000074671 420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
NubplQ9CWD8 Gm5528-201ENSMUST00000076314 480 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
NubplQ9CWD8 Defa24-201ENSMUST00000080533 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
NubplQ9CWD8 3110018I06Rik-201ENSMUST00000082269 1005 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
NubplQ9CWD8 Gm16020-201ENSMUST00000084281 210 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
NubplQ9CWD8 Mageb18-202ENSMUST00000113955 2163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
NubplQ9CWD8 Gm35206-201ENSMUST00000217945 1642 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
NubplQ9CWD8 Cavin4-201ENSMUST00000030033 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
NubplQ9CWD8 Selp-205ENSMUST00000162746 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
NubplQ9CWD8 Asap1-208ENSMUST00000176014 3435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
NubplQ9CWD8 Gm45645-201ENSMUST00000211470 1963 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
NubplQ9CWD8 Gm8232-201ENSMUST00000164277 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
NubplQ9CWD8 C630043F03Rik-201ENSMUST00000122923 2581 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
NubplQ9CWD8 Tmem232-202ENSMUST00000086722 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
NubplQ9CWD8 Abca17-202ENSMUST00000121226 5317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
NubplQ9CWD8 Vmn1r197-202ENSMUST00000226225 5326 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
NubplQ9CWD8 Pde1c-202ENSMUST00000114327 6821 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
NubplQ9CWD8 Spam1-202ENSMUST00000202331 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
NubplQ9CWD8 Slc4a4-202ENSMUST00000113218 3269 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
NubplQ9CWD8 Olfr435-202ENSMUST00000215565 2491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
NubplQ9CWD8 AC154642.2-201ENSMUST00000223657 2485 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
NubplQ9CWD8 H60c-201ENSMUST00000170893 2817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
NubplQ9CWD8 Gm37535-201ENSMUST00000194442 2365 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
NubplQ9CWD8 Lef1-203ENSMUST00000098611 2298 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
NubplQ9CWD8 Gm42994-201ENSMUST00000195964 2549 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
NubplQ9CWD8 Sox6-205ENSMUST00000169129 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
NubplQ9CWD8 Ubxn7-201ENSMUST00000115151 10318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
NubplQ9CWD8 Nr1h5-203ENSMUST00000196983 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
NubplQ9CWD8 Masp1-201ENSMUST00000089883 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
NubplQ9CWD8 Med12-203ENSMUST00000117203 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
NubplQ9CWD8 Gm15462-201ENSMUST00000133653 4580 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
NubplQ9CWD8 Scd1-201ENSMUST00000041331 4836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
NubplQ9CWD8 Lrrtm3-201ENSMUST00000105439 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
NubplQ9CWD8 Gm20754-202ENSMUST00000192642 1357 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
NubplQ9CWD8 Patj-203ENSMUST00000102792 3755 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
NubplQ9CWD8 Nol8-203ENSMUST00000221142 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
NubplQ9CWD8 Enpp6-201ENSMUST00000039840 4970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
NubplQ9CWD8 Heatr1-201ENSMUST00000059270 6780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
NubplQ9CWD8 Gcc2-207ENSMUST00000162041 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
NubplQ9CWD8 Sh3rf2-202ENSMUST00000074679 4444 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
NubplQ9CWD8 Fam107b-204ENSMUST00000115054 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
NubplQ9CWD8 Trp63-205ENSMUST00000115306 4691 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
NubplQ9CWD8 Rpl31-ps10-201ENSMUST00000116034 378 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
NubplQ9CWD8 Gm11858-201ENSMUST00000117935 838 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
NubplQ9CWD8 Gm11903-201ENSMUST00000118958 727 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
NubplQ9CWD8 Rpl31-ps11-201ENSMUST00000119898 377 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
NubplQ9CWD8 Rpl31-ps12-201ENSMUST00000119957 375 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
NubplQ9CWD8 Gm12535-201ENSMUST00000121025 484 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
NubplQ9CWD8 Gm23657-201ENSMUST00000122623 294 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
NubplQ9CWD8 Gm25178-201ENSMUST00000122633 325 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
NubplQ9CWD8 Gm14503-201ENSMUST00000130337 1164 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
NubplQ9CWD8 Stau2-209ENSMUST00000145092 564 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
NubplQ9CWD8 Gm24680-201ENSMUST00000158759 126 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
NubplQ9CWD8 Gm16138-201ENSMUST00000159341 821 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
NubplQ9CWD8 Obox3-204ENSMUST00000173912 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
NubplQ9CWD8 Gm27042-201ENSMUST00000181109 1097 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
NubplQ9CWD8 Gm27018-201ENSMUST00000181136 225 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
NubplQ9CWD8 Rpl31-ps8-201ENSMUST00000181935 378 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
NubplQ9CWD8 Gm8245-201ENSMUST00000182434 987 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
NubplQ9CWD8 Gm27014-201ENSMUST00000182658 937 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.6 ms