Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

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Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Ttc41-201ENSMUST00000061458 1815 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Ceacam1-208ENSMUST00000206676 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Triqk-203ENSMUST00000183345 3545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr1338-202ENSMUST00000214922 2947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 2610021A01Rik-201ENSMUST00000163475 4004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm29194-201ENSMUST00000189250 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm43557-201ENSMUST00000197100 2370 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Ddr2-205ENSMUST00000194690 8590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Mir678-201ENSMUST00000102114 84 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Trbv1-201ENSMUST00000103262 417 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm25614-201ENSMUST00000104013 133 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm23484-201ENSMUST00000104178 131 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm14391-202ENSMUST00000109055 965 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm13196-201ENSMUST00000118297 379 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm11444-201ENSMUST00000146433 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 4930403D09Rik-201ENSMUST00000147359 635 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 2610035D17Rik-204ENSMUST00000150712 947 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm14419-203ENSMUST00000156844 752 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Crnde-205ENSMUST00000179400 651 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Rps19-ps6-201ENSMUST00000181233 438 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm5181-201ENSMUST00000183140 971 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Mir6239-201ENSMUST00000183564 105 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm18254-201ENSMUST00000185699 1204 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm29197-201ENSMUST00000185922 702 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm28341-201ENSMUST00000190883 472 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm28425-202ENSMUST00000191542 621 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm38305-201ENSMUST00000194825 223 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 1700021F02Rik-201ENSMUST00000197576 350 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm17833-201ENSMUST00000197629 1065 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 5033403H07Rik-202ENSMUST00000198248 756 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Ccl24-202ENSMUST00000201401 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm44705-201ENSMUST00000206719 339 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm19228-201ENSMUST00000214030 717 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 AC132237.3-201ENSMUST00000220867 549 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 AC164436.1-201ENSMUST00000227074 772 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem213-201ENSMUST00000031851 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm9837-201ENSMUST00000057722 731 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Vmn1r50-202ENSMUST00000089417 2059 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm44956-201ENSMUST00000208277 2887 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr458-202ENSMUST00000216650 1799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm38026-201ENSMUST00000193284 3880 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 4930548H24Rik-201ENSMUST00000031020 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp143-205ENSMUST00000211798 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Oprk1-203ENSMUST00000160339 2481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Uevld-201ENSMUST00000094398 4616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Zbtb44-202ENSMUST00000167346 1308 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Spata31d1d-201ENSMUST00000052978 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 C3ar1-201ENSMUST00000042081 4305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm29461-201ENSMUST00000189232 4176 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Kcnj16-201ENSMUST00000106635 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm43279-201ENSMUST00000202376 2512 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr961-202ENSMUST00000219295 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Aass-201ENSMUST00000031707 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp78-202ENSMUST00000108559 1539 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm43606-201ENSMUST00000195938 3556 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 AC153501.1-201ENSMUST00000218156 1860 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Krt222-202ENSMUST00000103132 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Vmn2r45-201ENSMUST00000164845 3619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Erc2-208ENSMUST00000210924 4871 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 9405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Gm7945-201ENSMUST00000164948 1428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Tank-202ENSMUST00000112494 2698 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr1513-202ENSMUST00000215147 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc28aQ8CEI3 Gm43339-201ENSMUST00000200032 1606 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc28aQ8CEI3 Gm25725-201ENSMUST00000104528 130 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc28aQ8CEI3 Gm15007-201ENSMUST00000119982 710 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc28aQ8CEI3 Gm11688-201ENSMUST00000122145 308 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc28aQ8CEI3 Gm13179-202ENSMUST00000151994 978 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc28aQ8CEI3 Tnfsf10-202ENSMUST00000174840 989 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc28aQ8CEI3 Gm26662-201ENSMUST00000181129 548 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc28aQ8CEI3 Gm37260-201ENSMUST00000193748 1251 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc28aQ8CEI3 Gm42887-201ENSMUST00000202469 1119 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc28aQ8CEI3 4933402C06Rik-203ENSMUST00000207559 1227 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc28aQ8CEI3 Gm44565-201ENSMUST00000208194 269 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem156-206ENSMUST00000212640 1271 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc28aQ8CEI3 D730003K21Rik-202ENSMUST00000217456 533 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc28aQ8CEI3 Arhgef33-207ENSMUST00000224966 490 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc28aQ8CEI3 AC131586.4-201ENSMUST00000228424 668 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr761-201ENSMUST00000049620 1029 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr424-201ENSMUST00000053941 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr420-201ENSMUST00000068403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr127-201ENSMUST00000076331 1095 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc28aQ8CEI3 C030015A19Rik-201ENSMUST00000203368 2551 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc28aQ8CEI3 Gstz1-201ENSMUST00000063117 1656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc28aQ8CEI3 Gm12292-201ENSMUST00000122911 2433 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc28aQ8CEI3 9930111J21Rik2-201ENSMUST00000093152 2403 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc28aQ8CEI3 9930111J21Rik1-201ENSMUST00000093153 2403 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc28aQ8CEI3 2610001J05Rik-201ENSMUST00000139231 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc28aQ8CEI3 Stag2-203ENSMUST00000115073 6171 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc28aQ8CEI3 Gm30655-202ENSMUST00000222732 2808 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc28aQ8CEI3 Tpx2-207ENSMUST00000178997 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc28aQ8CEI3 Gm7982-202ENSMUST00000136313 1536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc28aQ8CEI3 Efcab7-201ENSMUST00000097959 1713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc28aQ8CEI3 Fmn1-201ENSMUST00000081349 4235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc28aQ8CEI3 Dlgap5-208ENSMUST00000180299 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc28aQ8CEI3 Gm26648-201ENSMUST00000181925 5831 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc28aQ8CEI3 C87436-201ENSMUST00000050497 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr1333-202ENSMUST00000214477 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc28aQ8CEI3 Cacnb4-203ENSMUST00000102761 8039 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccdc28aQ8CEI3 Rgs22-203ENSMUST00000172831 4006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
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