Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Gm3033-201ENSMUST00000112792 438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Gm15621-201ENSMUST00000119162 364 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Gm14640-201ENSMUST00000145800 437 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Rpl9-ps1-202ENSMUST00000182502 576 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Mir7020-201ENSMUST00000183787 70 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Gm28985-201ENSMUST00000189261 356 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 n-TStga1-201ENSMUST00000199903 109 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Gm43850-201ENSMUST00000202021 578 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Gm18838-201ENSMUST00000204855 886 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Gm25515-201ENSMUST00000083858 157 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Gm37984-201ENSMUST00000191641 3733 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Slx4ip-202ENSMUST00000099311 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Tenm2-202ENSMUST00000102801 9908 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Epha7-202ENSMUST00000080934 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Gm16025-202ENSMUST00000161923 2425 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Fam168a-205ENSMUST00000207875 4077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
NischQ80TM9 Msantd4-201ENSMUST00000047173 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 AC140409.2-201ENSMUST00000216936 3079 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 Gm2a-201ENSMUST00000000608 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 Palld-201ENSMUST00000034057 3566 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 C5ar2-201ENSMUST00000098792 3429 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 CT010470.1-201ENSMUST00000225364 1876 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 Smgc-203ENSMUST00000109276 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 Msn-201ENSMUST00000117399 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 Gm16085-201ENSMUST00000144575 453 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 Gm11292-201ENSMUST00000146121 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 Gm42880-201ENSMUST00000198028 459 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 Dysf-211ENSMUST00000168387 6501 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 Olfr686-202ENSMUST00000214147 2646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 Tmem167b-202ENSMUST00000106622 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 Cacna1c-222ENSMUST00000190285 6585 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 Gm3294-201ENSMUST00000164104 7367 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 Dapp1-203ENSMUST00000136613 2950 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 Slc25a40-202ENSMUST00000170496 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 Helz-201ENSMUST00000075012 6218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 Olfr381-204ENSMUST00000215358 2658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 Gtf3c2-210ENSMUST00000202639 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 Gm5970-201ENSMUST00000131638 1216 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 Gm2042-202ENSMUST00000180706 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 1700124L16Rik-202ENSMUST00000189308 546 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 Gm34066-201ENSMUST00000210156 825 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 AC165256.1-201ENSMUST00000216687 670 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 Gm31698-203ENSMUST00000217115 690 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 Prl3d3-201ENSMUST00000073601 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 Zc3h11a-201ENSMUST00000027736 4395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 Gm805-201ENSMUST00000181667 3160 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 Ctnnd1-217ENSMUST00000111691 5380 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 Stag1-201ENSMUST00000041418 5909 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 Anapc1-201ENSMUST00000014499 8942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 Trio-210ENSMUST00000227337 6375 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 Bdp1-204ENSMUST00000109379 7567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 Rgs4-201ENSMUST00000027991 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 Gbp3-202ENSMUST00000106221 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 4921539H07Rik-201ENSMUST00000197200 2985 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 Snhg17-209ENSMUST00000186993 3144 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 U2surp-209ENSMUST00000217176 3111 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 Ctps2-202ENSMUST00000101095 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 Eya3-213ENSMUST00000180250 5020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 Gm12643-201ENSMUST00000116078 374 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 Gm24179-201ENSMUST00000158925 127 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 Platr2-201ENSMUST00000180834 521 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 Gm27210-201ENSMUST00000184263 402 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 Gm37187-201ENSMUST00000193425 341 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 Gm37573-201ENSMUST00000193993 931 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 Fxyd1-207ENSMUST00000205778 438 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 Gm44705-201ENSMUST00000206719 339 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 Olfr587-ps1-202ENSMUST00000209201 477 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 Olfr565-ps1-201ENSMUST00000209824 944 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 AC166352.1-201ENSMUST00000215483 1105 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 Tas2r144-201ENSMUST00000063489 960 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 Olfr1307-202ENSMUST00000099606 939 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 Osbpl9-216ENSMUST00000161363 2356 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 Rasef-202ENSMUST00000102837 5158 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 Gm37120-201ENSMUST00000193350 5959 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 Gm28322-201ENSMUST00000185627 1475 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 Olfr324-203ENSMUST00000216965 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 Gm21671-201ENSMUST00000162387 2421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 Armc8-203ENSMUST00000186049 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 Flnb-201ENSMUST00000052678 9100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 Csde1-214ENSMUST00000199240 3457 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 Med23-201ENSMUST00000020159 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 Rrp12-201ENSMUST00000038677 4319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 Ncald-204ENSMUST00000120746 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 Gm26538-201ENSMUST00000180512 3498 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 Trbv12-2-201ENSMUST00000103269 385 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 Gm13455-201ENSMUST00000118767 517 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 Gm15149-201ENSMUST00000119370 360 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 Gm7212-201ENSMUST00000120817 348 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 Gm22210-201ENSMUST00000158101 144 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 AC163660.1-201ENSMUST00000223696 818 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 AC139197.1-201ENSMUST00000228332 813 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 Lcn9-201ENSMUST00000023978 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 Bpifa2-201ENSMUST00000048103 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 Mmp12-202ENSMUST00000065079 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 Gm26130-201ENSMUST00000083171 138 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 Adgrl3-216ENSMUST00000121641 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 Tdrd1-201ENSMUST00000078723 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 Rai14-207ENSMUST00000227506 4732 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
NischQ80TM9 Fubp1-202ENSMUST00000166984 6523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
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