Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Sh3rf2-202ENSMUST00000074679 4444 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Olfr605-202ENSMUST00000215417 2921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Olfr62-202ENSMUST00000213189 2570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Hdac9-205ENSMUST00000209902 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Akt3-203ENSMUST00000111160 4735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm10610-202ENSMUST00000207184 2693 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm37647-201ENSMUST00000194556 3143 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Olfr972-203ENSMUST00000216167 1522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Dnase1l1-202ENSMUST00000075821 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Olfr610-203ENSMUST00000217627 1643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Prr15l-204ENSMUST00000107636 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Fbxw7-203ENSMUST00000107678 4073 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm805-201ENSMUST00000181667 3160 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm12608-201ENSMUST00000122013 1715 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Parp11-201ENSMUST00000039680 3746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm44950-201ENSMUST00000206403 2296 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Vgll1-201ENSMUST00000033465 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Ssxb2-202ENSMUST00000103000 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Lrrc51-208ENSMUST00000106968 766 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Q3U6N9 4933400A11Rik-203ENSMUST00000112102 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm14865-201ENSMUST00000117523 494 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm5601-201ENSMUST00000118909 972 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm14791-201ENSMUST00000119061 1166 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm14863-201ENSMUST00000119648 307 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm12920-201ENSMUST00000121818 1186 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm12929-201ENSMUST00000122406 370 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm15242-201ENSMUST00000122459 283 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm15935-202ENSMUST00000141656 298 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm10364-202ENSMUST00000153034 1001 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm24286-201ENSMUST00000157632 128 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Six3os1-204ENSMUST00000161688 567 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm9672-201ENSMUST00000166437 425 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Vmn1r29-201ENSMUST00000168416 1023 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm9285-201ENSMUST00000177691 697 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm2888-202ENSMUST00000178577 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm44342-201ENSMUST00000196874 129 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm44383-201ENSMUST00000198940 129 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm40348-201ENSMUST00000199648 452 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm4860-201ENSMUST00000200368 454 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm43599-201ENSMUST00000202680 528 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Olfr258-ps1-202ENSMUST00000218625 1085 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm3678-201ENSMUST00000218888 492 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Q3U6N9 AC153793.1-201ENSMUST00000220956 1298 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Q3U6N9 AC122486.1-201ENSMUST00000221562 196 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm4808-201ENSMUST00000222283 1203 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Q3U6N9 AC154323.2-201ENSMUST00000226557 1151 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Q3U6N9 AC154806.5-205ENSMUST00000228828 411 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Ssxb1-201ENSMUST00000037297 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Olfr574-201ENSMUST00000052997 1041 ntAPPRIS P2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Tmem69-201ENSMUST00000069674 974 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Snora21-201ENSMUST00000082967 137 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Esrrg-202ENSMUST00000110938 5373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm20752-201ENSMUST00000197341 2833 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Q3U6N9 A730082K24Rik-203ENSMUST00000205913 1808 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Smad5-201ENSMUST00000069557 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Akap2-201ENSMUST00000043456 7211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Bdnf-207ENSMUST00000111047 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Eci2-203ENSMUST00000110251 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm7690-201ENSMUST00000190885 1399 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Clec2g-201ENSMUST00000000254 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm42478-201ENSMUST00000199252 1467 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm38009-201ENSMUST00000194884 3341 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Masp1-201ENSMUST00000089883 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Kcnmb2-204ENSMUST00000191869 1552 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Kif24-202ENSMUST00000108055 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Sh2d4b-201ENSMUST00000070328 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Q3U6N9 St18-201ENSMUST00000043578 5862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Plce1-201ENSMUST00000169713 9439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Aldh1l2-206ENSMUST00000146640 3938 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Nsd2-204ENSMUST00000114397 5738 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Zfp930-204ENSMUST00000212681 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm29379-201ENSMUST00000186305 2166 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm28276-201ENSMUST00000188508 2166 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm44737-201ENSMUST00000206950 2355 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm6249-201ENSMUST00000211142 3314 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Impg2-202ENSMUST00000069936 6890 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Q3U6N9 AC163354.1-201ENSMUST00000220620 1630 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Eif4e-201ENSMUST00000029803 4991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm3460-201ENSMUST00000167882 1809 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Slc17a3-204ENSMUST00000166467 4336 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Cstf2t-201ENSMUST00000066039 3750 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm42711-201ENSMUST00000197060 2302 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Q3U6N9 G6pd2-201ENSMUST00000053876 2348 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Mapk10-202ENSMUST00000112846 2617 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Kif9-202ENSMUST00000084952 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gprasp2-201ENSMUST00000113136 3736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Mrpl35-201ENSMUST00000065103 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Q3U6N9 2610524H06Rik-201ENSMUST00000100850 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm2178-201ENSMUST00000104927 357 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm16073-201ENSMUST00000116032 517 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
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Q3U6N9 Gm15715-201ENSMUST00000118032 283 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm12175-201ENSMUST00000122081 345 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Q3U6N9 4931413K12Rik-201ENSMUST00000142068 1282 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm12600-201ENSMUST00000146704 708 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm16112-201ENSMUST00000159075 382 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm27018-201ENSMUST00000181136 225 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Q3U6N9 1700102P08Rik-202ENSMUST00000192995 658 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm35801-201ENSMUST00000193927 479 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Q3U6N9 Gm43555-201ENSMUST00000196588 310 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
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